[petsc-users] Can not understand why convert matrix type from MPIAIJ to MATIS failed.
Junchao Zhang
junchao.zhang at gmail.com
Thu Apr 14 17:31:22 CDT 2022
Since you already have the test matrix, could you add "-mat_view binary" to
dump the matrix and send us the binaryoutput.* files for reproduce?
--Junchao Zhang
On Thu, Apr 14, 2022 at 10:09 AM 459543524 via petsc-users <
petsc-users at mcs.anl.gov> wrote:
> Sir, I can not understand why my convert from MPIAIJ to MATIS failed.
>
> I already have a matrix A, create by follow commands
> ---------------------------------------------------------------------
> Mat A;
> MatCreateAIJ(...)
> MatSetValues(...)
> MatAssemblyBegin(A, MAT_FINAL_ASSEMBLY);
> MatAssemblyEnd(A, MAT_FINAL_ASSEMBLY);
> ---------------------------------------------------------------------
> I want convert the matrix A to MATIS type for future BDDC operation, as
> advised by ex 72.
> ---------------------------------------------------------------------
> Mat J;
> MatConvert(A, MATIS, MAT_INITIAL_MATRIX, &J);
> ---------------------------------------------------------------------
>
> The command failed with the stacktrace
> [0]PETSC ERROR: --------------------- Error Message
> --------------------------------------------------------------
> [0]PETSC ERROR: Argument out of range
> [0]PETSC ERROR: Scatter indices in ix are out of range
> [0]PETSC ERROR: See https://petsc.org/release/faq/ for trouble shooting.
> [0]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.15.4, Sep 01, 2021
> [0]PETSC ERROR: Unknown Name on a named xuhui-Office by xuhui Thu Apr 14
> 23:06:08 2022
> [0]PETSC ERROR: Configure options --prefix=/opt/petsc/debug_int64
> --download-mumps --download-scalapack --download-superlu_dist
> --download-parmetis --download-metis --with-64-bit-indices=1
> [0]PETSC ERROR: #1 VecScatterCreate() at
> /home/xuhui/Temp/petsc-3.15.4/src/vec/is/sf/interface/vscat.c:767
> [0]PETSC ERROR: #2 MatISSetUpScatters_Private() at
> /home/xuhui/Temp/petsc-3.15.4/src/mat/impls/is/matis.c:2403
> [0]PETSC ERROR: #3 MatSetLocalToGlobalMapping_IS() at
> /home/xuhui/Temp/petsc-3.15.4/src/mat/impls/is/matis.c:2501
> [0]PETSC ERROR: #4 MatSetLocalToGlobalMapping() at
> /home/xuhui/Temp/petsc-3.15.4/src/mat/interface/matrix.c:2093
> [0]PETSC ERROR: #5 MatConvert_XAIJ_IS() at
> /home/xuhui/Temp/petsc-3.15.4/src/mat/impls/is/matis.c:651
> [0]PETSC ERROR: #6 MatConvert() at
> /home/xuhui/Temp/petsc-3.15.4/src/mat/interface/matrix.c:4439
> ^C[mpiexec at xuhui-Office] Sending Ctrl-C to processes as requested
>
>
> I have no idea why this happen. Thanks for your time.
>
>
> Further information:
> The matrix A is distributed on 4 processes.
> We can view the matrix as follows:
>
> Mat Object: 4 MPI processes
> type: mpiaij
> row 0: (0, 168.75) (1, 0.) (2, 0.) (3, 0.) (4, 0.) (5, 0.) (6, 0.)
> (7, 0.)
> row 1: (0, 0.) (1, 168.75) (2, 0.) (3, 0.) (4, 0.) (5, 0.) (6, 0.)
> (7, 0.)
> row 2: (0, 0.) (1, 0.) (2, 168.75) (3, 0.) (6, 0.) (7, 0.) (8, 0.)
> (9, 0.) (12, 0.) (13, 0.)
> row 3: (0, 0.) (1, 0.) (2, 0.) (3, 168.75) (6, 0.) (7, 0.) (8, 0.)
> (9, 0.) (12, 0.) (13, 0.)
> row 4: (0, 0.) (1, 0.) (4, 150.) (5, -25.) (6, -100.) (7, 25.) (16,
> -25.) (17, 25.) (18, 0.) (19, -25.)
> row 5: (0, 0.) (1, 0.) (4, -25.) (5, 150.) (6, 25.) (7, -50.) (16,
> 0.) (17, -50.) (18, -25.) (19, 0.)
> row 6: (0, 0.) (1, 0.) (2, 0.) (3, 0.) (4, -100.) (5, 25.) (6,
> 300.) (7, -50.) (12, -100.) (13, 25.) (18, -50.) (19, 25.) (24, 0.)
> (25, -25.)
> row 7: (0, 0.) (1, 0.) (2, 0.) (3, 0.) (4, 25.) (5, -50.) (6, -50.)
> (7, 300.) (12, 25.) (13, -50.) (18, 25.) (19, -100.) (24, -25.) (25,
> 0.)
> row 8: (2, 0.) (3, 0.) (8, 150.) (9, 0.) (10, 0.) (11, 0.) (12, 0.)
> (13, 0.) (14, 0.) (15, 0.)
> row 9: (2, 0.) (3, 0.) (8, 0.) (9, 150.) (10, 0.) (11, 0.) (12, 0.)
> (13, 0.) (14, 0.) (15, 0.)
> row 10: (8, 0.) (9, 0.) (10, 150.) (11, 0.) (14, 0.) (15, 0.)
> row 11: (8, 0.) (9, 0.) (10, 0.) (11, 150.) (14, 0.) (15, 0.)
> row 12: (2, 0.) (3, 0.) (6, -100.) (7, 25.) (8, 0.) (9, 0.) (12,
> 300.) (13, -50.) (14, -100.) (15, 25.) (24, -50.) (25, 25.) (26, 0.)
> (27, -25.)
> row 13: (2, 0.) (3, 0.) (6, 25.) (7, -50.) (8, 0.) (9, 0.) (12,
> -50.) (13, 300.) (14, 25.) (15, -50.) (24, 25.) (25, -100.) (26,
> -25.) (27, 0.)
> row 14: (8, 0.) (9, 0.) (10, 0.) (11, 0.) (12, -100.) (13, 25.) (14,
> 150.) (15, -25.) (26, -25.) (27, 0.)
> row 15: (8, 0.) (9, 0.) (10, 0.) (11, 0.) (12, 25.) (13, -50.) (14,
> -25.) (15, 150.) (26, 25.) (27, -50.)
> row 16: (4, -25.) (5, 0.) (16, 150.) (17, -25.) (18, -100.) (19,
> 25.) (20, -25.) (21, 25.) (22, 0.) (23, -25.)
> row 17: (4, 25.) (5, -50.) (16, -25.) (17, 150.) (18, 25.) (19,
> -50.) (20, 0.) (21, -50.) (22, -25.) (23, 0.)
> row 18: (4, 0.) (5, -25.) (6, -50.) (7, 25.) (16, -100.) (17, 25.)
> (18, 300.) (19, -50.) (22, -50.) (23, 25.) (24, -100.) (25, 25.) (28,
> 0.) (29, -25.)
> row 19: (4, -25.) (5, 0.) (6, 25.) (7, -100.) (16, 25.) (17, -50.)
> (18, -50.) (19, 300.) (22, 25.) (23, -100.) (24, 25.) (25, -50.) (28,
> -25.) (29, 0.)
> row 20: (16, -25.) (17, 0.) (20, 75.) (21, -25.) (22, -50.) (23, 25.)
> row 21: (16, 25.) (17, -50.) (20, -25.) (21, 75.) (22, 0.) (23, -25.)
> row 22: (16, 0.) (17, -25.) (18, -50.) (19, 25.) (20, -50.) (21, 0.)
> (22, 150.) (23, -25.) (28, -50.) (29, 25.)
> row 23: (16, -25.) (17, 0.) (18, 25.) (19, -100.) (20, 25.) (21,
> -25.) (22, -25.) (23, 150.) (28, 0.) (29, -25.)
> row 24: (6, 0.) (7, -25.) (12, -50.) (13, 25.) (18, -100.) (19, 25.)
> (24, 300.) (25, -50.) (26, -100.) (27, 25.) (28, -50.) (29, 25.) (30,
> 0.) (31, -25.)
> row 25: (6, -25.) (7, 0.) (12, 25.) (13, -100.) (18, 25.) (19, -50.)
> (24, -50.) (25, 300.) (26, 25.) (27, -50.) (28, 25.) (29, -100.) (30,
> -25.) (31, 0.)
> row 26: (12, 0.) (13, -25.) (14, -25.) (15, 25.) (24, -100.) (25,
> 25.) (26, 150.) (27, -25.) (30, -25.) (31, 0.)
> row 27: (12, -25.) (13, 0.) (14, 0.) (15, -50.) (24, 25.) (25, -50.)
> (26, -25.) (27, 150.) (30, 25.) (31, -50.)
> row 28: (18, 0.) (19, -25.) (22, -50.) (23, 0.) (24, -50.) (25, 25.)
> (28, 150.) (29, -25.) (30, -50.) (31, 25.)
> row 29: (18, -25.) (19, 0.) (22, 25.) (23, -25.) (24, 25.) (25,
> -100.) (28, -25.) (29, 150.) (30, 0.) (31, -25.)
> row 30: (24, 0.) (25, -25.) (26, -25.) (27, 25.) (28, -50.) (29, 0.)
> (30, 75.) (31, 0.)
> row 31: (24, -25.) (25, 0.) (26, 0.) (27, -50.) (28, 25.) (29, -25.)
> (30, 0.) (31, 75.)
>
>
> ------------------------------
> 徐辉，Xu Hui
> 清华大学航天航空学院博士研究生
> PhD Candidate, School of Aerospace Engineering
> Tsinghua University
> Tel： 188-1152-7137
> Mail：459543524 at qq.com
>
>
>
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/petsc-users/attachments/20220414/dc9ed4ac/attachment.html>
More information about the petsc-users
mailing list