[petsc-users] Undestanding how to increase the overlap

[TARDIEU Nicolas]

Hi Matt,
The isovl is in global numbering. I am pasting the output of the script  :

#--------------------------------------------------------------------------------
# The matrix
# -----------
[1,0]<stdout>:Mat Object: 2 MPI processes
[1,0]<stdout>:  type: mpiaij
[1,0]<stdout>:row 0: (0, 0.)
[1,0]<stdout>:row 1: (1, 1.)
[1,0]<stdout>:row 2: (2, 2.)
[1,0]<stdout>:row 3: (3, 3.)
[1,0]<stdout>:row 4: (4, 4.)
[1,0]<stdout>:row 5: (5, 5.)
#--------------------------------------------------------------------------------
# The IS isovl before the call to increaseOverlap
# -----------
[1,0]<stdout>:locSize before = 3
[1,0]<stdout>:IS Object: 1 MPI processes
[1,0]<stdout>:  type: stride
[1,0]<stdout>:Number of indices in (stride) set 3
[1,0]<stdout>:0 0
[1,0]<stdout>:1 1
[1,0]<stdout>:2 2
[1,1]<stdout>:locSize before = 3
[1,1]<stdout>:IS Object: 1 MPI processes
[1,1]<stdout>:  type: stride
[1,1]<stdout>:Number of indices in (stride) set 3
[1,1]<stdout>:0 3
[1,1]<stdout>:1 4
[1,1]<stdout>:2 5
#--------------------------------------------------------------------------------
# The IS isovl after the call to increaseOverlap
# -----------
[1,0]<stdout>:locSize after = 3
[1,0]<stdout>:IS Object: 1 MPI processes
[1,0]<stdout>:  type: general
[1,0]<stdout>:Number of indices in set 3
[1,0]<stdout>:0 0
[1,0]<stdout>:1 1
[1,0]<stdout>:2 2
[1,1]<stdout>:locSize after = 3
[1,1]<stdout>:IS Object: 1 MPI processes
[1,1]<stdout>:  type: general
[1,1]<stdout>:Number of indices in set 3
[1,1]<stdout>:0 3
[1,1]<stdout>:1 4
[1,1]<stdout>:2 5
#--------------------------------------------------------------------------------

Regards,
Nicolas
--
Nicolas Tardieu
Ing PhD Computational Mechanics
EDF - R&D Dpt ERMES
PARIS-SACLAY, FRANCE
________________________________
De : knepley at gmail.com <knepley at gmail.com>
Envoyé : jeudi 18 janvier 2024 15:29
À : TARDIEU Nicolas <nicolas.tardieu at edf.fr>
Cc : petsc-users at mcs.anl.gov <petsc-users at mcs.anl.gov>
Objet : Re: [petsc-users] Undestanding how to increase the overlap

On Thu, Jan 18, 2024 at 9:24 AM TARDIEU Nicolas via petsc-users <petsc-users at mcs.anl.gov<mailto:petsc-users at mcs.anl.gov>> wrote:
Dear PETSc Team,

I am trying to understand how to increase the overlap of a matrix.
I wrote the attached petsc4py script where I build a simple matrix and play with the increaseOverlap method. Unfortunately, before and after the call, nothing changes in the index set. FYI, I have tried to mimic src/ksp/ksp/tutorials/ex82.c<https://petsc.org/main/src/ksp/ksp/tutorials/ex82.c.html> line 72:76.
Here is how I run the script : "mpiexec -n 2 python test_overlap.py"

Could you please indicate what I am missing ?

Usually matrix functions like this take input in global indices. It looks like your isovl is in local indices. Am I reading that correctly?

  Thanks,

     Matt

Regards,
Nicolas
--
Nicolas Tardieu
Ing PhD Computational Mechanics
EDF - R&D Dpt ERMES
PARIS-SACLAY, FRANCE

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-- Norbert Wiener

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