so, this workflow completes all the jobs but then just hangs indefinitely at the end...maybe a stray cleanup job? <br><br>log is here:<br><br>/home/skenny/swift_logs/corr-20111010-2104-fl5yngd9.log<br><br>just tweaked the sites file a bit from what david sent me:<br>
<br><config><br><pool handle="RANGER"><br>     <execution provider="coaster" jobManager="gt2:SGE" url="<a href="http://gatekeeper.ranger.tacc.teragrid.org">gatekeeper.ranger.tacc.teragrid.org</a>"/><br>
     <filesystem provider="gsiftp" url="gsiftp://<a href="http://gridftp.ranger.tacc.teragrid.org">gridftp.ranger.tacc.teragrid.org</a>"/><br>     <profile namespace="globus" key="maxtime">28800</profile><br>
     <profile namespace="globus" key="maxWallTime">00:15:00</profile><br>     <profile namespace="globus" key="jobsPerNode">1</profile><br>     <profile namespace="globus" key="nodeGranularity">64</profile><br>
     <profile namespace="globus" key="maxNodes">256</profile><br>     <profile namespace="globus" key="queue">normal</profile><br>     <profile namespace="karajan" key="jobThrottle">1</profile><br>
     <profile namespace="globus" key="project">TG-DBS080004N</profile><br>     <profile namespace="globus" key="pe">16way</profile><br>     <profile namespace="karajan" key="initialScore">10000</profile><br>
     <workdirectory>/work/00043/tg457040/sidgrid_out/skenny</workdirectory><br></pool><br></config><br><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Oct 10, 2011 at 3:43 PM, Sarah Kenny <span dir="ltr"><<a href="mailto:skenny@uchicago.edu">skenny@uchicago.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">ok, thanks, got in the queue now...also, realized my last run may have been using the old swift. apparently i had SWIFT_HOME set in my env and that overrides the newer swift i had set in my PATH. <br>
<font color="#888888"><br>~sk<br><br></font><div class="gmail_quote"><div class="im">
On Mon, Oct 10, 2011 at 12:28 PM, David Kelly <span dir="ltr"><<a href="mailto:davidk@ci.uchicago.edu" target="_blank">davidk@ci.uchicago.edu</a>></span> wrote:<br></div><div><div></div><div class="h5"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex">

Sarah,<br>
<br>
Can you give this another try with the latest 0.93? I made some changes to the coaster and sge providers and was able to get it working with a simple catns script. Here is the configuration file I was using:<br>
<br>
<config><br>
<pool handle="ranger"><br>
      <execution provider="coaster" jobManager="gt2:SGE" url="<a href="http://gatekeeper.ranger.tacc.teragrid.org" target="_blank">gatekeeper.ranger.tacc.teragrid.org</a>"/><br>
<div>      <filesystem provider="gsiftp" url="gsiftp://<a href="http://gridftp.ranger.tacc.teragrid.org" target="_blank">gridftp.ranger.tacc.teragrid.org</a>"/><br>
</div>      <profile namespace="globus" key="maxtime">3600</profile><br>
      <profile namespace="globus" key="maxWallTime">00:00:03</profile><br>
      <profile namespace="globus" key="jobsPerNode">1</profile><br>
      <profile namespace="globus" key="nodeGranularity">16</profile><br>
      <profile namespace="globus" key="maxNodes">16</profile><br>
      <profile namespace="globus" key="queue">development</profile><br>
      <profile namespace="karajan" key="jobThrottle">0.9</profile><br>
<div>      <profile namespace="globus" key="project">TG-DBS080004N</profile><br>
</div><div>      <profile namespace="globus" key="pe">16way</profile><br>
</div>      <workdirectory>/share/home/01503/davidkel/swiftwork</workdirectory><br>
</pool><br>
</config><br>
<br>
Thanks,<br>
<div>David<br>
<br>
----- Original Message -----<br>
</div><div>> From: "Sarah Kenny" <<a href="mailto:skenny@uchicago.edu" target="_blank">skenny@uchicago.edu</a>><br>
> To: "Justin M Wozniak" <<a href="mailto:wozniak@mcs.anl.gov" target="_blank">wozniak@mcs.anl.gov</a>><br>
> Cc: "Swift Devel" <<a href="mailto:swift-devel@ci.uchicago.edu" target="_blank">swift-devel@ci.uchicago.edu</a>>, "Swift User" <<a href="mailto:swift-user@ci.uchicago.edu" target="_blank">swift-user@ci.uchicago.edu</a>><br>


</div><div><div></div><div>> Sent: Friday, October 7, 2011 3:13:57 PM<br>
> Subject: Re: [Swift-user] gram on ranger<br>
> /home/skenny/swift_logs/dummy-20111005-0126-6575n7x5.log<br>
><br>
> on ci<br>
><br>
><br>
> On Fri, Oct 7, 2011 at 8:16 AM, Justin M Wozniak < <a href="mailto:wozniak@mcs.anl.gov" target="_blank">wozniak@mcs.anl.gov</a><br>
> > wrote:<br>
><br>
><br>
><br>
> Can I take a look at the log?<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> On Thu, 6 Oct 2011, Sarah Kenny wrote:<br>
><br>
><br>
><br>
> hey all, i'm trying to submit to gram on ranger using the latest swift<br>
> (built from trunk). it failes like so:<br>
><br>
> Cannot submit job<br>
> Caused by:<br>
> org.globus.cog.abstraction. impl.common.task. TaskSubmissionException:<br>
> Cannot<br>
> submit job<br>
> Caused by: org.globus.gram.GramException: Parameter not supported<br>
> Cannot submit job<br>
><br>
> the gram log was saying first that 'jobsPerNode' is not supported so i<br>
> changed it to workersPerNode and then it was saying 'maxnodes' is not<br>
> supported. here's my sites file:<br>
><br>
> <config><br>
> <pool handle="RANGER"><br>
> <profile namespace="karajan" key="initialScore">10000</ profile><br>
> <profile namespace="karajan" key="jobThrottle">1</profile><br>
> <profile namespace="globus" key="maxWallTime">00:15:00</ profile><br>
> <profile namespace="globus" key="maxTime">86400</profile><br>
> <profile namespace="globus" key="slots">1</profile><br>
> <profile namespace="globus" key="maxNodes">256</profile><br>
> <profile namespace="globus" key="pe">16way</profile><br>
> <profile namespace="globus" key="workersPerNode">1</ profile><br>
> <profile namespace="globus" key="nodeGranularity">64</ profile><br>
> <profile namespace="globus" key="queue">normal</profile><br>
> <profile namespace="globus" key="project">TG-DBS080004N</ profile><br>
> <filesystem provider="gsiftp" url="gsiftp://<br>
</div></div>> gridftp.ranger.tacc.teragrid. org "/><br>
<div>> <execution provider="coaster" jobManager="gt2:gt2:SGE" url="<br>
</div>> gatekeeper.ranger.tacc. <a href="http://teragrid.org" target="_blank">teragrid.org</a> "/><br>
<div>> <execution provider="gt2" jobManager="SGE" url="<br>
> gatekeeper.ranger.tacc. <a href="http://teragrid.org" target="_blank">teragrid.org</a> "/><br>
</div>> <workdirectory>/work/00043/ tg457040</workdirectory><br>
<div>> </pool><br>
> </config><br>
><br>
> thoughts? ideas?<br>
><br>
> --<br>
> Justin M Wozniak<br>
><br>
><br>
><br>
> --<br>
> Sarah Kenny<br>
> Programmer ~ Brain Circuits Laboratory ~ Rm 2224 Bio Sci III<br>
> University of California Irvine, Dept. of Neurology ~ <a href="tel:773-818-8300" value="+17738188300" target="_blank">773-818-8300</a><br>
><br>
><br>
</div>> _______________________________________________<br>
> Swift-user mailing list<br>
> <a href="mailto:Swift-user@ci.uchicago.edu" target="_blank">Swift-user@ci.uchicago.edu</a><br>
> <a href="https://lists.ci.uchicago.edu/cgi-bin/mailman/listinfo/swift-user" target="_blank">https://lists.ci.uchicago.edu/cgi-bin/mailman/listinfo/swift-user</a><br>
</blockquote></div></div></div><div><div></div><div class="h5"><br><br clear="all"><br>-- <br>Sarah Kenny<br>Programmer ~ Brain Circuits Laboratory ~ Rm 2224 Bio Sci III<br>University of California Irvine, Dept. of Neurology ~ <a href="tel:773-818-8300" value="+17738188300" target="_blank">773-818-8300</a><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Sarah Kenny<br>Programmer ~ Brain Circuits Laboratory ~ Rm 2224 Bio Sci III<br>University of California Irvine, Dept. of Neurology ~ 773-818-8300<br><br>