<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7654.12">
<TITLE>RE: [Swift-user] using swift on a cluster</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Aha!<BR>
<BR>
I needed the universe=vanilla line.<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
Erin M. Hodgess, PhD<BR>
Associate Professor<BR>
Department of Computer and Mathematical Sciences<BR>
University of Houston - Downtown<BR>
mailto: hodgesse@uhd.edu<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
-----Original Message-----<BR>
From: swift-user-bounces@ci.uchicago.edu on behalf of Hodgess, Erin<BR>
Sent: Wed 10/21/2009 3:07 AM<BR>
To: Michael Wilde<BR>
Cc: swift-user@ci.uchicago.edu<BR>
Subject: RE: [Swift-user] using swift on a cluster<BR>
<BR>
Hello!<BR>
<BR>
We are indeed using condor.<BR>
<BR>
I wanted to try a small test run, but am running into trouble:<BR>
<BR>
[hodgess@grid bin]$ cat myjob.submit<BR>
executable=/usr/bin/id<BR>
output=results.output<BR>
error=results.error<BR>
log=results.log<BR>
queue<BR>
[hodgess@grid bin]$ condor_submit myjob.submit<BR>
Submitting job(s).<BR>
Logging submit event(s).<BR>
1 job(s) submitted to cluster 15.<BR>
[hodgess@grid bin]$ ls results*<BR>
results.error  results.log  results.output<BR>
You have new mail in /var/spool/mail/hodgess<BR>
[hodgess@grid bin]$ cat results.log<BR>
000 (015.000.000) 10/21 03:06:03 Job submitted from host: <192.168.1.11:46274><BR>
...<BR>
001 (015.000.000) 10/21 03:06:05 Job executing on host: <10.1.255.244:44508><BR>
...<BR>
002 (015.000.000) 10/21 03:06:05 (1) Job not properly linked for Condor.<BR>
...<BR>
009 (015.000.000) 10/21 03:06:05 Job was aborted by the user.<BR>
...<BR>
[hodgess@grid bin]$<BR>
<BR>
I'm not sure why the job is not linked.<BR>
<BR>
Any suggestions would be much appreciated.<BR>
<BR>
Thanks,<BR>
Erin<BR>
<BR>
<BR>
Erin M. Hodgess, PhD<BR>
Associate Professor<BR>
Department of Computer and Mathematical Sciences<BR>
University of Houston - Downtown<BR>
mailto: hodgesse@uhd.edu<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
-----Original Message-----<BR>
From: Michael Wilde [<A HREF="mailto:wilde@mcs.anl.gov">mailto:wilde@mcs.anl.gov</A>]<BR>
Sent: Tue 10/20/2009 10:49 PM<BR>
To: Hodgess, Erin<BR>
Cc: swift-user@ci.uchicago.edu<BR>
Subject: Re: [Swift-user] using swift on a cluster<BR>
<BR>
Hi Erin,<BR>
<BR>
I'm assuming you meant "use Swift to run jobs on the compute nodes of<BR>
the cluster"?<BR>
<BR>
If so, you first need to find out what scheduler (also called "batch<BR>
system" or "local resource manager") the cluster is running.<BR>
<BR>
Thats typical one of these: PBS, Condor, or SGE.<BR>
<BR>
Either ask your system administrator, or see if the "man" command or<BR>
similar probes give you a clue:<BR>
<BR>
Condor: condor_q -version<BR>
<BR>
condor_q -version<BR>
$CondorVersion: 7.2.4 Jun 16 2009 BuildID: 159529 $<BR>
$CondorPlatform: I386-LINUX_RHEL5 $<BR>
<BR>
PBS: man qstat:<BR>
<BR>
   qstat(1B)  PBS<BR>
<BR>
SGE: man qstat:<BR>
<BR>
   QSTAT(1)   Sun Grid Engine User Commands<BR>
<BR>
<BR>
If its PBS or Condor, then the Swift user guide gives the sites.xml<BR>
entries to use.<BR>
<BR>
Tell us what you find, then try following the instructions in the user<BR>
guide, and follow up with questions as needed.<BR>
<BR>
- Mike<BR>
<BR>
<BR>
On 10/20/09 9:41 PM, Hodgess, Erin wrote:<BR>
> Hi Swift Users:<BR>
><BR>
> I'm on a cluster and would like to use swift on the different sites on<BR>
> the cluster.<BR>
><BR>
> How would I do that, please?<BR>
><BR>
> Thanks,<BR>
> Erin<BR>
><BR>
><BR>
> Erin M. Hodgess, PhD<BR>
> Associate Professor<BR>
> Department of Computer and Mathematical Sciences<BR>
> University of Houston - Downtown<BR>
> mailto: hodgesse@uhd.edu<BR>
><BR>
><BR>
> ------------------------------------------------------------------------<BR>
><BR>
> _______________________________________________<BR>
> Swift-user mailing list<BR>
> Swift-user@ci.uchicago.edu<BR>
> <A HREF="http://mail.ci.uchicago.edu/mailman/listinfo/swift-user">http://mail.ci.uchicago.edu/mailman/listinfo/swift-user</A><BR>
<BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>