<div dir="ltr">Hi Mihael,<div><br></div><div>Attached is the simplified version of my script and apps which has the same resume behavior I reported.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Ketan</div></div><div class="gmail_extra">
<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 3, 2013 at 9:52 PM, Mihael Hategan <span dir="ltr"><<a href="mailto:hategan@mcs.anl.gov" target="_blank">hategan@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Yeah, please send me the script or a simplified one. I have been using<br>
resume for a while, so it's not a general resume issue.<br>
<br>
Mihael<br>
<div><div class="h5"><br>
On Thu, 2013-10-03 at 20:45 -0500, Ketan Maheshwari wrote:<br>
> Hi,<br>
><br>
> It seems that the resume feature in trunk has some problems.<br>
><br>
> When I try to resume a workflow I am running, I get the following error:<br>
><br>
> $ swift -sites.file sites.gordon.xml -tc.file apps -config cf<br>
> workflow.swift -resume workflow-20131004-0107-09cxqmd5.0.rlog<br>
> Swift trunk swift-r7089 cog-r3775 (cog modified locally)<br>
> RunID: 20131004-0142-7l1ym0y9<br>
> Progress:  time: Fri, 04 Oct 2013 01:42:37 +0000<br>
><br>
> Execution failed:<br>
> java.lang.IndexOutOfBoundsException: Invalid index [14] for mA_file<br>
> swift:stageIn @ workflow, line: 347<br>
> Caused by: java.lang.IndexOutOfBoundsException: Invalid index [14] for<br>
> mA_file<br>
> at<br>
> org.griphyn.vdl.mapping.AbstractDataNode.checkNoValue(AbstractDataNode.java:716)<br>
> at<br>
> org.griphyn.vdl.mapping.AbstractDataNode.waitFor(AbstractDataNode.java:682)<br>
> at org.griphyn.vdl.karajan.lib.Stagein.function(Stagein.java:81)<br>
> at org.griphyn.vdl.karajan.lib.SwiftFunction.runBody(SwiftFunction.java:108)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.InternalFunction.run(InternalFunction.java:155)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.InvocationWrapper.run(InvocationWrapper.java:66)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.Sequential.run(Sequential.java:22)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.Function.runBody(Function.java:99)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.InvocationWrapper.runBody(InvocationWrapper.java:245)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.InvocationWrapper.run(InvocationWrapper.java:69)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.Sequential.run(Sequential.java:22)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.UParallel$1.run(UParallel.java:68)<br>
> at k.thr.LWThread.run(LWThread.java:228)<br>
> at<br>
> java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1145)<br>
> at<br>
> java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:615)<br>
> at java.lang.Thread.run(Thread.java:724)<br>
><br>
> I am trying to reproduce with a simpler example.<br>
><br>
> Thanks,<br>
> Hi,<br>
><br>
><br>
> It seems that the resume feature in trunk has some problems.<br>
><br>
><br>
> When I try to resume a workflow I am running, I get the following<br>
> error:<br>
><br>
><br>
> $ swift -sites.file sites.gordon.xml -tc.file apps -config cf<br>
> workflow.swift -resume workflow-20131004-0107-09cxqmd5.0.rlog<br>
> Swift trunk swift-r7089 cog-r3775 (cog modified locally)<br>
> RunID: 20131004-0142-7l1ym0y9<br>
> Progress:  time: Fri, 04 Oct 2013 01:42:37 +0000<br>
><br>
><br>
> Execution failed:<br>
> java.lang.IndexOutOfBoundsException: Invalid index [14] for mA_file<br>
> swift:stageIn @ workflow, line: 347<br>
> Caused by: java.lang.IndexOutOfBoundsException: Invalid index [14] for<br>
> mA_file<br>
> at<br>
> org.griphyn.vdl.mapping.AbstractDataNode.checkNoValue(AbstractDataNode.java:716)<br>
> at<br>
> org.griphyn.vdl.mapping.AbstractDataNode.waitFor(AbstractDataNode.java:682)<br>
> at org.griphyn.vdl.karajan.lib.Stagein.function(Stagein.java:81)<br>
> at<br>
> org.griphyn.vdl.karajan.lib.SwiftFunction.runBody(SwiftFunction.java:108)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.InternalFunction.run(InternalFunction.java:155)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.InvocationWrapper.run(InvocationWrapper.java:66)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.Sequential.run(Sequential.java:22)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.Function.runBody(Function.java:99)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.InvocationWrapper.runBody(InvocationWrapper.java:245)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.user.InvocationWrapper.run(InvocationWrapper.java:69)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.Sequential.run(Sequential.java:22)<br>
> at<br>
> org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.CompoundNode.runChild(CompoundNode.java:87)<br>
> at org.globus.cog.karajan.compiled.nodes.UParallel<br>
> $1.run(UParallel.java:68)<br>
> at k.thr.LWThread.run(LWThread.java:228)<br>
> at<br>
> java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1145)<br>
> at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor<br>
> $Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:615)<br>
> at java.lang.Thread.run(Thread.java:724)<br>
><br>
><br>
> I am trying to reproduce with a simpler example.<br>
><br>
><br>
> Thanks,<br>
> --<br>
> Ketan<br>
><br>
><br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Swift-devel mailing list<br>
> <a href="mailto:Swift-devel@ci.uchicago.edu">Swift-devel@ci.uchicago.edu</a><br>
> <a href="https://lists.ci.uchicago.edu/cgi-bin/mailman/listinfo/swift-devel" target="_blank">https://lists.ci.uchicago.edu/cgi-bin/mailman/listinfo/swift-devel</a><br>
<br>
<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><font face="'courier new', monospace">Ketan</font><br><br>
</div>