<div dir="ltr"><div>SDSC Gordon admins have limited java heap space to 256 on login nodes.<br><br></div>This is enabled via the following environment variable:<br><br>JAVA_TOOL_OPTIONS=-Xmx256m<br clear="all"><div><div><div>
<br></div><div>It seems coaster bootstrap does not like this:<br><br>mdw$ swift -sites.file sites.gordon.xml -tc.file apps -config cf workflow.swift<br>Swift trunk swift-r7089 cog-r3775<br>RunID: 20130919-2038-jef0ns83<br>
Progress:  time: Thu, 19 Sep 2013 20:38:42 +0000<br>Progress:  time: Thu, 19 Sep 2013 20:38:43 +0000  Submitting:2<br><br>Execution failed:<br>Exception in matrixgen:<br>    Arguments: [2544, 3300, mA.dat]<br>    Host: gordon<br>
    Directory: workflow-20130919-2038-jef0ns83/jobs/a/matrixgen-a1rnkhfl<br>    exception @ swift-int-staging.k, line: 162<br>Caused by: null<br>Caused by: org.globus.cog.abstraction.impl.common.task.TaskSubmissionException: Could not submit job<br>
Caused by: org.globus.cog.abstraction.impl.common.task.TaskSubmissionException: Could not start coaster service<br>Caused by: org.globus.cog.abstraction.impl.common.task.TaskSubmissionException: Task ended before registration was received.<br>
<br>Picked up JAVA_TOOL_OPTIONS: -Xmx256m<br>/bin/bash: line 54: 33675 Aborted                 /usr/java/latest/bin/java -Djava=/usr/java/latest/bin/java -DGLOBUS_TCP_PORT_RANGE=50000,51000 -DX509_USER_PROXY=/home/ketan/.globus/sshproxy-316831905-1379663604 -DX509_CERT_DIR=/home/ketan/.globus/sshCAcert-316831905-1379663604.pem -DGLOBUS_HOSTNAME=<a href="http://gordon.sdsc.xsede.org">gordon.sdsc.xsede.org</a> -Duser.home=/home/ketan -jar /tmp/bootstrap.RWIqFu <a href="http://swift.rcc.uchicago.edu:50001">http://swift.rcc.uchicago.edu:50001</a> <a href="https://128.135.112.73:50000">https://128.135.112.73:50000</a> 11836079986<br>
</div><div><br><br></div><div>Do I understand right that this is indeed the java heap space issue? or is it something else that I could work around with? Thanks for any ideas.<br></div><div><br>-- <br><font face="'courier new', monospace">Ketan</font><br>
<br>
</div></div></div></div>