I am seeing this error message at runtime on the SCEC workflow:<div><br></div><div><div>Progress:  time: Sun, 20 Nov 2011 10:20:51 -0600  Active:2  Finished successfully:4</div><div>[Fatal Error] :-1:-1: Premature end of file.</div>
<div>org.xml.sax.SAXParseException: Premature end of file.</div><div>        at org.apache.xerces.parsers.DOMParser.parse(Unknown Source)</div><div>        at org.apache.xerces.jaxp.DocumentBuilderImpl.parse(Unknown Source)</div>
<div>        at javax.xml.parsers.DocumentBuilder.parse(DocumentBuilder.java:124)</div><div>        at org.globus.cog.abstraction.impl.scheduler.sge.QueuePoller.processStdout(QueuePoller.java:191)</div><div>        at org.globus.cog.abstraction.impl.scheduler.common.AbstractQueuePoller.pollQueue(AbstractQueuePoller.java:170)</div>
<div>        at org.globus.cog.abstraction.impl.scheduler.common.AbstractQueuePoller.run(AbstractQueuePoller.java:82)</div><div>        at java.lang.Thread.run(Thread.java:619)</div><div>Progress:  time: Sun, 20 Nov 2011 10:21:02 -0600  Active:1  Finished successfully:4 Failed but can retry:1</div>
<div>Exception in simsgt:</div><div>Arguments: [TEST, processed/gridout_TEST, processed/TEST.modelbox, processed/TEST.fdloc, processed/TEST.cordfile, x]</div><div>Host: SGE</div><div>Directory: presgt-20111120-0852-n6cze3l8/jobs/d/simsgt-dlogn1jk</div>
<div>stderr.txt:</div><div>stdout.txt:</div><div><br></div><div>----</div><div><br></div><div>Caused by: java.io.IOException: Error while parsing XML</div><div><br></div><div><br></div><div>Exception in simsgt:</div><div>
Arguments: [TEST, processed/gridout_TEST, processed/TEST.modelbox, processed/TEST.fdloc, processed/TEST.cordfile, y]</div><div>Host: SGE</div><div>Directory: presgt-20111120-0852-n6cze3l8/jobs/e/simsgt-elogn1jk</div><div>
stderr.txt:</div><div>stdout.txt:</div><div><br></div><div>----</div><div><br></div><div>Caused by: java.io.IOException: Error while parsing XML</div><div><br></div><div><br></div><div>Final status:  time: Sun, 20 Nov 2011 10:21:02 -0600  Failed:2  Finished successfully:4</div>
<div>The following errors have occurred:</div><div>1. java.io.IOException: Error while parsing XML (2 times)</div><div><br></div><div><br></div><div>The log is: <a href="http://www.mcs.anl.gov/~ketan/presgt-20111120-0852-n6cze3l8.log">http://www.mcs.anl.gov/~ketan/presgt-20111120-0852-n6cze3l8.log</a></div>
<div><br></div><div>It shows the same error message at the end of the log. Does anyone else see this?</div><div><br></div><div><br></div>-- <br>Ketan<br><br><br>
</div>