Looking again, I think it may actually be a distinct issue that was triggered by some login node performance problems on PADS.  The mention of the same pbs submit file in .globus/scripts: PBS8380254050153377753.submit misled me.  <br>
<br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 20, 2011 at 4:49 PM, Mihael Hategan <span dir="ltr"><<a href="mailto:hategan@mcs.anl.gov">hategan@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div class="im">On Tue, 2011-09-20 at 14:00 -0500, Tim Armstrong wrote:<br>
> This looks like the same bug I encountered in 0.92.1:<br>
> <a href="https://bugzilla.mcs.anl.gov/swift/show_bug.cgi?id=569" target="_blank">https://bugzilla.mcs.anl.gov/swift/show_bug.cgi?id=569</a><br>
><br>
> This affects SwiftR so I'm trying to work out what my options are to<br>
> resolve it.  Is it possible to backport the fix to the 0.92 release?<br>
> I can do this myself, or simply patch my own version of the source if<br>
> you let me know the svn revision.<br>
<br>
</div>I don't think this was fixed. But I also don't think that it makes much<br>
difference. Are your jobs otherwise failing?<br>
<div class="im">><br>
> I'm also not sure what the overall best approach for bundling Swift<br>
> with SwiftR is.  My current approach is to simply include the most<br>
> recent stable Swift release, but I seem to be missing out on relevant<br>
> bugfixes from trunk.<br>
<br>
</div>You are also missing the lots and lots of bugs from trunk. We generally<br>
quickly backport fixes from trunk to the stable branch if they are found<br>
in both, but less quickly the other way around.<br>
<div class="im"><br>
>   I'm looking in the near future to start distributed SwiftR more<br>
> widely as a downloadable R package so pushing out bugfixes may become<br>
> more of a pain.  Any thoughts on which version of Swift I should<br>
> bundle with SwiftR in order to maximise stability?<br>
<br>
</div>The stable one.<br>
<br>
<br>
</blockquote></div><br>