<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Ok.  My mapping error has magically disappeared.  I updated to
    swift-r4175 and cog-r3057 from swift-r4171 and cog-r3056.  I am not
    sure what happened but have run my code 4-5 times with no mapping
    error.  <br>
    <br>
    I still have the condition hang.  However the output that is
    reported every 10s if no events happen is very helpful.  I am going
    through my scripts to track down on exactly what variable is hanging
    and if it hangs at the same place.<br>
    <br>
    On 3/6/11 7:22 PM, Jonathan Monette wrote:
    <blockquote cite="mid:4D743355.4050206@gmail.com" type="cite">
      <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
        http-equiv="Content-Type">
      I will test this out.  Currently I have another problem that
      appeared.  It was reported in thread "[Swift-devel] Error in Swift
      mapping".<span class="Apple-style-span" style="border-collapse:
        separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Times; font-style:
        normal; font-variant: normal; font-weight: normal;
        letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; font-size: medium;"></span>  I
      have not put together a simple script that re-creates this problem
      as I just went through my first wave of midterms. I will see if I
      can put together a script this week.<br>
      <br>
      On 3/6/11 3:46 PM, Mihael Hategan wrote:
      <blockquote cite="mid:1299448004.16332.2.camel@blabla2.none"
        type="cite">
        <pre wrap="">Given that this does not seem to be a java deadlock, I added a hang
checker to swift. If nothing is being executed inside karajan and no
jobs are running in any ten second interval, it will dump future and
thread information to the log file.

This is in swift trunk r4171.

Can you give that a try and report back the details?

Mihael

On Sat, 2011-02-19 at 14:54 -0600, Jonathan Monette wrote:
</pre>
        <blockquote type="cite">
          <pre wrap="">Yes.  It always seems to hang at the same place.

Attached is my montage script.  It hangs in the mFitBatch function at 
the mConcatFit app call.  All other files have been created up to that 
step but that app never runs.

On 2/17/11 3:39 PM, Mihael Hategan wrote:
</pre>
          <blockquote type="cite">
            <pre wrap="">On Thu, 2011-02-17 at 15:13 -0600, Jonathan Monette wrote:
</pre>
            <blockquote type="cite">
              <pre wrap="">Hello,
      My workflow seems to be hanging.  This is trunk swift-r4107 and
cog-r3051.  Attached is a compressed log file and the jstack output for
my workflow.  The jstack file says it is waiting for a condition and my
workflow hangs.
</pre>
            </blockquote>
            <pre wrap="">There's lots of stuff waiting because that's what they do when they
don't have anything else to do. So I don't see a problem there.

There are no jobs going to the coaster service, so clearly things aren't
progressing.

So now the question is: does this happen every time you run it or just
some times?

Also, please send the swift script.

Mihael


</pre>
          </blockquote>
        </blockquote>
        <pre wrap="">
</pre>
      </blockquote>
    </blockquote>
  </body>
</html>