
<html>


<head>


<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">


</head>


<body style="overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;">


Hello,


<div><br>


</div>


<div>I found a type elsewhere in my code and have fixed this issue.</div>


<div><br>


</div>


<div>Thanks,</div>


<div>Matt<br id="lineBreakAtBeginningOfMessage">


<div><br>


<blockquote type="cite">


<div>On 27 Nov 2024, at 12:06 PM, Matthew Thomas <Matthew.Thomas1@anu.edu.au> wrote:</div>


<br class="Apple-interchange-newline">


<div>


<div style="overflow-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;">


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">Hello, </span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><br>


</span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><br>


</span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


When I use MatMPIAIJSetPreallocation I get an argument out of range error, as below,</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><br>


</span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><br>


</span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">[15]PETSC ERROR: Argument out of range</span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">[15]PETSC ERROR: New nonzero at (8,421) caused a malloc. Use MatSetOption(A, MAT_NEW_NONZERO_ALLOCATION_ERR, PETSC_FALSE) to turn off this check</span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><br>


</span></div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<br>


</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


However, when I run the code again with identical parameters without MatMPIAIJSetPreallocation, there is no non-zero at the location that caused the error (8, 421). Using -mat_view I can see that row 8 only contains a single value at column 8, which is expected


 and what I have allocated for.</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<br>


</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


I have also checked that every time I call MatSetValues that this location is not being set.</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<br>


</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


I am very confident my dnnz and onnz arrays have been set correctly, do you have any idea why this new non-zero is created?</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<br>


</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


I am using Petsc version 3.22.1 and Slepc version 3.22.1 with fortran.</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<br>


</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


This issue does not occur with small number of processors, (1-8), however, this error is consistent when I use >8 processors.</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


<br>


</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


Thanks,</div>


<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-stretch: normal; font-size: 11px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal;">


Matt</div>


</div>


</div>


</blockquote>


</div>


<br>


</div>


</body>


</html>