<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Wingdings;
        panose-1:5 0 0 0 0 0 0 0 0 0;}
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Aptos;
        panose-1:2 11 6 4 2 2 2 2 2 4;}
@font-face
        {font-family:Monaco;
        panose-1:0 0 0 0 0 0 0 0 0 0;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Aptos",sans-serif;
        mso-ligatures:standardcontextual;}
p.MsoListParagraph, li.MsoListParagraph, div.MsoListParagraph
        {mso-style-priority:34;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:.5in;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Aptos",sans-serif;
        mso-ligatures:standardcontextual;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Aptos",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
/* List Definitions */
@list l0
        {mso-list-id:1620264191;
        mso-list-type:hybrid;
        mso-list-template-ids:-1722896034 -73105058 67698691 67698693 67698689 67698691 67698693 67698689 67698691 67698693;}
@list l0:level1
        {mso-level-start-at:0;
        mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:\F0B7 ;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:Symbol;
        mso-fareast-font-family:Aptos;
        mso-bidi-font-family:"Times New Roman";}
@list l0:level2
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:o;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:"Courier New";}
@list l0:level3
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:\F0A7 ;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:Wingdings;}
@list l0:level4
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:\F0B7 ;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:Symbol;}
@list l0:level5
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:o;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:"Courier New";}
@list l0:level6
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:\F0A7 ;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:Wingdings;}
@list l0:level7
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:\F0B7 ;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:Symbol;}
@list l0:level8
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:o;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:"Courier New";}
@list l0:level9
        {mso-level-number-format:bullet;
        mso-level-text:\F0A7 ;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;
        font-family:Wingdings;}
ol
        {margin-bottom:0in;}
ul
        {margin-bottom:0in;}
--></style>
</head>
<body lang="EN-US" link="#467886" vlink="#96607D" style="word-wrap:break-word">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Hi all,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">The following codes are how I used to setup PC mat ordering:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  // Setup KSP/PC (at this moment, user-input options and commandline options are available)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  SNESGetKSP(snes, &ksp);<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  KSPSetFromOptions(ksp);<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  PC pc;<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  KSPGetPC(ksp, &pc);<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  <span style="background:yellow;mso-highlight:yellow">
PCFactorSetMatOrderingType(pc, MATORDERINGRCM);</span><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  // PCFactorSetLevels(pc, 5);<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  SNESSetFromOptions(snes);<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">After switching to PETSc 3.21, this no longer works, and can be confirmed from ‘-snes_view’ output:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">  PC Object: 1 MPI process<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">    type: ilu<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">      out-of-place factorization<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">      0 levels of fill<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">      tolerance for zero pivot 2.22045e-14<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">      using diagonal shift to prevent zero pivot [NONZERO]<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:Monaco">      <span style="background:yellow;mso-highlight:yellow">
matrix ordering: natural</span><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">The command line option still works, i.e., ‘-pc_factor_mat_ordering_type rcm’ gives me the correct behavior.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Questions:<o:p></o:p></span></p>
<ul style="margin-top:0in" type="disc">
<li class="MsoListParagraph" style="margin-left:0in;mso-list:l0 level1 lfo1"><span style="font-size:11.0pt">Is this a bug introduced in the new version, or<o:p></o:p></span></li><li class="MsoListParagraph" style="margin-left:0in;mso-list:l0 level1 lfo1"><span style="font-size:11.0pt">With the new version, I should call this function at a different time?<o:p></o:p></span></li></ul>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Best,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">-Ling<o:p></o:p></span></p>
</div>
</body>
</html>