<head><!-- BaNnErBlUrFlE-HeAdEr-start -->
<style>
  #pfptBannerughp6nt { all: revert !important; display: block !important; 
    visibility: visible !important; opacity: 1 !important; 
    background-color: #D0D8DC !important; 
    max-width: none !important; max-height: none !important }
  .pfptPrimaryButtonughp6nt:hover, .pfptPrimaryButtonughp6nt:focus {
    background-color: #b4c1c7 !important; }
  .pfptPrimaryButtonughp6nt:active {
    background-color: #90a4ae !important; }
</style>

<!-- BaNnErBlUrFlE-HeAdEr-end -->
</head><!-- BaNnErBlUrFlE-BoDy-start -->
<!-- Preheader Text : BEGIN -->
<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">
 Hi, Based on 'cg. c', I'm trying to develop my own Krylov solver (a projected conjugate gradient). I want to integrate this into my C++ code, where I already have an interface for PETSC which works well. However, I have the following questions
</div>
<!-- Preheader Text : END -->

<!-- Email Banner : BEGIN -->
<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">ZjQcmQRYFpfptBannerStart</div>

<!--[if ((ie)|(mso))]>
  <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" width="100%" style="padding: 16px 0px 16px 0px; direction: ltr" ><tr><td>
    <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" style="padding: 0px 10px 5px 6px; width: 100%; border-radius:4px; border-top:4px solid #90a4ae;background-color:#D0D8DC;"><tr><td valign="top">
      <table align="left" border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" style="padding: 4px 8px 4px 8px">
        <tr><td style="color:#000000; font-family: 'Arial', sans-serif; font-weight:bold; font-size:14px; direction: ltr">
          This Message Is From an External Sender
        </td></tr>
        <tr><td style="color:#000000; font-weight:normal; font-family: 'Arial', sans-serif; font-size:12px; direction: ltr">
          This message came from outside your organization.
        </td></tr>

      </table>

    </td></tr></table>
  </td></tr></table>
<![endif]-->

<![if !((ie)|(mso))]>
  <div dir="ltr"  id="pfptBannerughp6nt" style="all: revert !important; display:block !important; text-align: left !important; margin:16px 0px 16px 0px !important; padding:8px 16px 8px 16px !important; border-radius: 4px !important; min-width: 200px !important; background-color: #D0D8DC !important; background-color: #D0D8DC; border-top: 4px solid #90a4ae !important; border-top: 4px solid #90a4ae;">
    <div id="pfptBannerughp6nt" style="all: unset !important; float:left !important; display:block !important; margin: 0px 0px 1px 0px !important; max-width: 600px !important;">
      <div id="pfptBannerughp6nt" style="all: unset !important; display:block !important; visibility: visible !important; background-color: #D0D8DC !important; color:#000000 !important; color:#000000; font-family: 'Arial', sans-serif !important; font-family: 'Arial', sans-serif; font-weight:bold !important; font-weight:bold; font-size:14px !important; line-height:18px !important; line-height:18px">
        This Message Is From an External Sender
      </div>
      <div id="pfptBannerughp6nt" style="all: unset !important; display:block !important; visibility: visible !important; background-color: #D0D8DC !important; color:#000000 !important; color:#000000; font-weight:normal; font-family: 'Arial', sans-serif !important; font-family: 'Arial', sans-serif; font-size:12px !important; line-height:18px !important; line-height:18px; margin-top:2px !important;">
This message came from outside your organization.
      </div>

    </div>

    <div style="clear: both !important; display: block !important; visibility: hidden !important; line-height: 0 !important; font-size: 0.01px !important; height: 0px"> </div>
  </div>
<![endif]>

<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">ZjQcmQRYFpfptBannerEnd</div>
<!-- Email Banner : END -->

<!-- BaNnErBlUrFlE-BoDy-end -->
<html><body><div id="zimbraEditorContainer" style="font-family: arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000" class="57"><div>Hi,<br></div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>Based on 'cg.c', I'm trying to develop my own Krylov solver (a projected conjugate gradient). I want to integrate this into my C++ code, where I already have an interface for PETSC which works well. However, I have the following questions :<br data-mce-bogus="1"></div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>- Where am I sensed to put my 'cg_projected.c' and 'pcgimpl.h' files? Should they go in a directory petsc/src/ksp/ksp/impls/pcg/? If so, how do I compile that? Is it simply by adding this directory to the Makefile in petsc/src/ksp/ksp/impls/?<br data-mce-bogus="1"></div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>- I have also tried the basic approach of putting these two files in directories of my own C++ code  and compiling. However, I have this error at the link edition:<br></div><div>[100%] Linking CXX shared library libcoeur.so<br>/usr/bin/ld: src/solvers/libsolvers.a(cg_projected.c.o): warning: relocation against `petscstack' in read-only section `.text'<br>/usr/bin/ld: src/solvers/libsolvers.a(cg_projected.c.o): relocation R_X86_64_PC32 against symbol `petscstack' can not be used when making a shared object; recompilé avec -fPIC<br>/usr/bin/ld : échec de l'édition de liens finale : bad value<br>collect2: error: ld returned 1 exit status<br>make[2]: *** [CMakeFiles/coeur.dir/build.make:121 : libcoeur.so] Erreur 1<br>make[1]: *** [CMakeFiles/Makefile2:286 : CMakeFiles/coeur.dir/all] Erreur 2<br>make: *** [Makefile:91 : all] Erreur 2<br data-mce-bogus="1"></div><div><br></div><div>Could you please tell me what is the right way to proceed?<br data-mce-bogus="1"></div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>Thank you,<br data-mce-bogus="1"></div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>Julien</div><div data-marker="__SIG_POST__">-- <br></div><div><div id="n" style="font-size:larger;line-height:1.4;font-weight:bolder;color:rgb(95,37,159)">Julien Bruchon </div><div id="f">Professeur IMT - Responsable du département MPE</div><div>LGF - UMR CNRS 5307 - <a href="https://urldefense.us/v3/__https://www.mines-stetienne.fr/lgf/__;!!G_uCfscf7eWS!dQgv-IRWC7OgdDf1X9Oew4nHSgleq2ty0AszuRPj70bBiFeCcT4RibQVAvv6FFeD081W1yY8IczRHAHopA0crg$" target="_blank">https://www.mines-stetienne.fr/lgf/</a><br></div><div>
    Mines Saint-Étienne, une école de l'Institut Mines-Télécom
    </div><div><a href="https://urldefense.us/v3/__https://gitlab.emse.fr/bruchon/Coeur/-/wikis/home__;!!G_uCfscf7eWS!dQgv-IRWC7OgdDf1X9Oew4nHSgleq2ty0AszuRPj70bBiFeCcT4RibQVAvv6FFeD081W1yY8IczRHAG6pz3FrQ$" target="_blank" rel="noopener">Librairie Éléments Finis Coeur</a><br></div><div style="font-size:smaller;font-style:oblique">
    <div id="l1">0477420072</div>
    <div id="l2"></div>
    <div id="l3"></div>
    </div></div></div></body></html>