<!-- BaNnErBlUrFlE-BoDy-start -->
<!-- Preheader Text : BEGIN -->
<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">
 Thank you Satish, I'll give it a try. From: Satish Balay <balay@ mcs. anl. gov> Sent: Thursday, May 2, 2024 5: 51 PM To: Vanella, Marcos (Fed) <marcos. vanella@ nist. gov> Cc: Junchao Zhang <junchao. zhang@ gmail. com>; petsc-users
</div>
<!-- Preheader Text : END -->

<!-- Email Banner : BEGIN -->
<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">ZjQcmQRYFpfptBannerStart</div>

<!--[if ((ie)|(mso))]>
  <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" width="100%" style="padding: 16px 0px 16px 0px; direction: ltr" ><tr><td>
    <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" style="padding: 0px 10px 5px 6px; width: 100%; border-radius:4px; border-top:4px solid #90a4ae;background-color:#D0D8DC;"><tr><td valign="top">
      <table align="left" border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" style="padding: 4px 8px 4px 8px">
        <tr><td style="color:#000000; font-family: 'Arial', sans-serif; font-weight:bold; font-size:14px; direction: ltr">
          This Message Is From an External Sender
        </td></tr>
        <tr><td style="color:#000000; font-weight:normal; font-family: 'Arial', sans-serif; font-size:12px; direction: ltr">
          This message came from outside your organization.
        </td></tr>

      </table>

    </td></tr></table>
  </td></tr></table>
<![endif]-->

<![if !((ie)|(mso))]>
  <div dir="ltr"  id="pfptBanner24qw2qj" style="all: revert !important; display:block !important; text-align: left !important; margin:16px 0px 16px 0px !important; padding:8px 16px 8px 16px !important; border-radius: 4px !important; min-width: 200px !important; background-color: #D0D8DC !important; background-color: #D0D8DC; border-top: 4px solid #90a4ae !important; border-top: 4px solid #90a4ae;">
    <div id="pfptBanner24qw2qj" style="all: unset !important; float:left !important; display:block !important; margin: 0px 0px 1px 0px !important; max-width: 600px !important;">
      <div id="pfptBanner24qw2qj" style="all: unset !important; display:block !important; visibility: visible !important; background-color: #D0D8DC !important; color:#000000 !important; color:#000000; font-family: 'Arial', sans-serif !important; font-family: 'Arial', sans-serif; font-weight:bold !important; font-weight:bold; font-size:14px !important; line-height:18px !important; line-height:18px">
        This Message Is From an External Sender
      </div>
      <div id="pfptBanner24qw2qj" style="all: unset !important; display:block !important; visibility: visible !important; background-color: #D0D8DC !important; color:#000000 !important; color:#000000; font-weight:normal; font-family: 'Arial', sans-serif !important; font-family: 'Arial', sans-serif; font-size:12px !important; line-height:18px !important; line-height:18px; margin-top:2px !important;">
This message came from outside your organization.
      </div>

    </div>

    <div style="clear: both !important; display: block !important; visibility: hidden !important; line-height: 0 !important; font-size: 0.01px !important; height: 0px"> </div>
  </div>
<![endif]>

<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">ZjQcmQRYFpfptBannerEnd</div>
<!-- Email Banner : END -->

<!-- BaNnErBlUrFlE-BoDy-end -->
<html>
<head><!-- BaNnErBlUrFlE-HeAdEr-start -->
<style>
  #pfptBanner24qw2qj { all: revert !important; display: block !important; 
    visibility: visible !important; opacity: 1 !important; 
    background-color: #D0D8DC !important; 
    max-width: none !important; max-height: none !important }
  .pfptPrimaryButton24qw2qj:hover, .pfptPrimaryButton24qw2qj:focus {
    background-color: #b4c1c7 !important; }
  .pfptPrimaryButton24qw2qj:active {
    background-color: #90a4ae !important; }
</style>

<!-- BaNnErBlUrFlE-HeAdEr-end -->

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Thank you Satish, I'll give it a try.</div>
<div id="appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> Satish Balay <balay@mcs.anl.gov><br>
<b>Sent:</b> Thursday, May 2, 2024 5:51 PM<br>
<b>To:</b> Vanella, Marcos (Fed) <marcos.vanella@nist.gov><br>
<b>Cc:</b> Junchao Zhang <junchao.zhang@gmail.com>; petsc-users <petsc-users@mcs.anl.gov>; Mueller, Eric V. (Fed) <eric.mueller@nist.gov><br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] Compiling PETSc in Polaris with gnu</font>
<div> </div>
</div>
<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt;">
<div class="PlainText">Perhaps you need to:<br>
<br>
module load craype-accel-nvidia80<br>
<br>
And then rebuild PETSc, your application<br>
<br>
And have the same list of modules loaded at runtime.<br>
<br>
Satish<br>
<br>
On Thu, 2 May 2024, Vanella, Marcos (Fed) via petsc-users wrote:<br>
<br>
> Thank you Satish and Junchao! I was able to compile PETSc with your configure options + suitesparse and hypre, and then compile my fortran code linking to PETSc.<br>
> But when I try to run my test run I'm picking up an error at the very beginning:<br>
> <br>
> MPICH ERROR [Rank 0] [job id 01eb3c4a-28a7-4178-aced-512b4fb704c6] [Thu May  2 20:44:26 2024] [x3006c0s19b1n0] - Abort(-1) (rank 0 in comm 0): MPIDI_CRAY_init: GPU_SUPPORT_ENABLED is requested, but GTL library is not linked<br>
>  (Other MPI error)<br>
> <br>
> aborting job:<br>
> MPIDI_CRAY_init: GPU_SUPPORT_ENABLED is requested, but GTL library is not linked<br>
> <br>
> It says in the Polaris user guide that:<br>
> <br>
> The environment variable MPICH_GPU_SUPPORT_ENABLED=1 needs to be set if your application requires MPI-GPU support whereby the MPI library sends and receives data directly from GPU buffers. In this case, it will be important to have the craype-accel-nvidia80 
 module loaded both when compiling your application and during runtime to correctly link against a GPU Transport Layer (GTL) MPI library. Otherwise, you'll likely see GPU_SUPPORT_ENABLED is requested, but GTL library is not linked errors during runtime.<br>
> <br>
> I tried adding loading this module (also needed to add nvhpc-mixed) in my submission script but I get the same result.<br>
> I'll get in touch with alcf help on this.<br>
> <br>
> <br>
> <br>
> ________________________________<br>
> From: Satish Balay <balay@mcs.anl.gov><br>
> Sent: Thursday, May 2, 2024 11:58 AM<br>
> To: Junchao Zhang <junchao.zhang@gmail.com><br>
> Cc: petsc-users <petsc-users@mcs.anl.gov>; Vanella, Marcos (Fed) <marcos.vanella@nist.gov>; Mueller, Eric V. (Fed) <eric.mueller@nist.gov><br>
> Subject: Re: [petsc-users] Compiling PETSc in Polaris with gnu<br>
> <br>
> I just tried a build  (used default versions) - and the following builds for me [on the login node].<br>
> <br>
> <br>
> module use /soft/modulefiles<br>
> module load PrgEnv-gnu<br>
> module load cudatoolkit-standalone<br>
> module load cray-libsci<br>
> ./configure --with-cc=cc --with-fc=ftn --with-cxx=CC --with-make-np=4 --with-cuda=1 --with-cudac=nvcc --with-cuda-arch=80 \<br>
>   --with-debugging=0 COPTFLAGS=-O2 CXXOPTFLAGS=-O2 FOPTFLAGS=-O2 CUDAOPTFLAGS=-O2 --download-kokkos --download-kokkos-kernels<br>
> make<br>
> <br>
> Satish<br>
> <br>
> ---<br>
> <br>
> balay@polaris-login-01:~> module list<br>
> <br>
> Currently Loaded Modules:<br>
>   1) libfabric/1.15.2.0       4) darshan/3.4.4     7) cray-dsmml/0.2.2   10) cray-pals/1.3.4     13) PrgEnv-gnu/8.5.0<br>
>   2) craype-network-ofi       5) gcc-native/12.3   8) cray-mpich/8.1.28  11) cray-libpals/1.3.4  14) cudatoolkit-standalone/12.2.2<br>
>   3) perftools-base/23.12.0   6) craype/2.7.30     9) cray-pmi/6.1.13    12) craype-x86-milan    15) cray-libsci/23.12.5<br>
> <br>
> <br>
> On Thu, 2 May 2024, Junchao Zhang wrote:<br>
> <br>
> > I used cudatoolkit-standalone/12.4.1 and gcc-12.3.<br>
> ><br>
> > Be sure to use the latest petsc/main or petsc/release, which contains fixes<br>
> > for Polaris.<br>
> ><br>
> > --Junchao Zhang<br>
> ><br>
> ><br>
> > On Thu, May 2, 2024 at 10:23 AM Satish Balay via petsc-users <<br>
> > petsc-users@mcs.anl.gov> wrote:<br>
> ><br>
> > > Try:<br>
> > ><br>
> > > module use /soft/modulefiles<br>
> > ><br>
> > > Satish<br>
> > ><br>
> > > On Thu, 2 May 2024, Vanella, Marcos (Fed) via petsc-users wrote:<br>
> > ><br>
> > > > Hi all, it seems the modules in Polaris have changed (can't find<br>
> > > cudatoolkit-standalone anymore).<br>
> > > > Does anyone have recent experience compiling the library with gnu and<br>
> > > cuda in the machine?<br>
> > > > Thank you!<br>
> > > > Marcos<br>
> > > ><br>
> > ><br>
> > ><br>
> ><br>
> <br>
</div>
</span></font></div>
</body>
</html>