<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><meta name=Generator content="Microsoft Word 14 (filtered medium)"><style><!--
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 class=apple-converted-space> </span><a href="https://petsc.org/release/faq/"><span style='color:purple'>https://petsc.org/release/faq/</span></a></span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: The line numbers in the error traceback are not always exact.</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #1 BLASdot()</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #2 VecNorm_Seq() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\petsc-3.18.6\src\vec\vec\impls\seq\bvec2.c:216</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #3 VecNorm() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\petsc-3.18.6\src\vec\vec\interface\rvector.c:237</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #4 VecNormalize() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\petsc-3.18.6\src\vec\vec\interface\rvector.c:318</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #5 KSPGMRESCycle() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\petsc-3.18.6\src\ksp\ksp\impls\gmres\gmres.c:111</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #6 KSPSolve_GMRES() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\petsc-3.18.6\src\ksp\ksp\impls\gmres\gmres.c:228</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #7 KSPSolve_Private() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\petsc-3.18.6\src\ksp\ksp\interface\itfunc.c:899</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0]PETSC ERROR: #8 KSPSolve() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\petsc-3.18.6\src\ksp\ksp\interface\itfunc.c:1071</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'> </span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>job aborted:</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[ranks] message</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'> </span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>[0] application aborted</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 59, comm rank 0</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'> </span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'> </span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'> </span><o:p></o:p></p></div><div><div style='border:none;border-top:solid windowtext 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in;border-color:currentcolor currentcolor;border-image: none'><div><p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span class=apple-converted-space><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> </span></span><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>petsc-users [<a href="mailto:petsc-users-bounces@mcs.anl.gov"><span style='color:purple'>mailto:petsc-users-bounces@mcs.anl.gov</span></a>]<span class=apple-converted-space> </span><b>On Behalf Of<span class=apple-converted-space> </span></b>Thuc Bui<br><b>Sent:</b><span class=apple-converted-space> </span>Monday, September 18, 2023 4:24 PM<br><b>To:</b><span class=apple-converted-space> </span>'Barry Smith'<br><b>Cc:</b><span class=apple-converted-space> </span>'PETSc users list'<br><b>Subject:</b><span class=apple-converted-space> </span>Re: [petsc-users] Problem with BLASdot in 3.19.4</span><o:p></o:p></p></div></div></div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Thanks a lot Barry, for getting back to me. Will do what you have suggested, and get back with the results.</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'> </span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Best regards,</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Thuc</span><o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'> </span><o:p></o:p></p></div><div><div style='border:none;border-top:solid windowtext 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in;border-color:currentcolor currentcolor;border-image: none'><div><p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span class=apple-converted-space><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> </span></span><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>Barry Smith [<a href="mailto:bsmith@petsc.dev"><span style='color:purple'>mailto:bsmith@petsc.dev</span></a>]<span class=apple-converted-space> </span><br><b>Sent:</b><span class=apple-converted-space> </span>Monday, September 18, 2023 3:43 PM<br><b>To:</b><span class=apple-converted-space> </span>Thuc Bui<br><b>Cc:</b><span class=apple-converted-space> </span>PETSc users list<br><b>Subject:</b><span class=apple-converted-space> </span>Re: [petsc-users] Problem with BLASdot in 3.19.4</span><o:p></o:p></p></div></div></div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div><div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div></div><div><p class=MsoNormal>  Ok, two things are being changed at the same time: the version  of PETSc and the version of Visual Studio. <o:p></o:p></p></div><div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal>  Could you please try with the new Visual Studio version but the same older PETSc version? If that works could you try with the old Visual Studio version but the new PETSc version? <o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal>  Barry<o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div><div><p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'> <o:p></o:p></p><div><div><p class=MsoNormal>On Sep 18, 2023, at 6:26 PM, Thuc Bui <<a href="mailto:bui@calcreek.com"><span style='color:purple'>bui@calcreek.com</span></a>> wrote:<o:p></o:p></p></div></div><div><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p></div><div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Dear Petsc users and experts,</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>If someone can direct me how to track this bug, I would really appreciate it.</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>The Petsc DLL library version 3.19.4 was built on Windows 10 with Visual Studio 2022, and with Microsoft MPI 10.1.2 and Intel MKL 2020.3.279. The same code works fine with Petsc 3.18.6 using the same versions of MS MPI and Intel MKL, and built with Visual Studio 2019.</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>When my code calls PetscCall(KSPSolve(...)), it gets to PetscCall(KSPGMRESCycle(...)), PetscCall(VecNormalize(VEC_VV(0), &res)), PetscCall(VecNorm(x, NORM_2, &norm)) and then crashes in VecNorm_Seq() at:</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>                PetscCallBLAS("BLASdot", ztmp[type == NORM_1_AND_2] = PetscSqrtReal(PetscRealPart(BLASdot_(&bn, xx, &one, xx, &one))));</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>I tried to step into BLASdot_, but was unable to. I assume BLASdot_ belong to Intel MKL, and its library does not contain debug information. After the code exits, the errors are shown below the hash line.</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Should I install the latest Intel MKL to work with Petsc 3.19.4?</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Many thanks in advance for your help,</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Thuc Bui</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Senior R&D Engineer</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>Calabazas Creek Research, Inc</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>(650) 948-5361</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>###############################################</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: Caught signal number 11 SEGV: Segmentation Violation, probably memory access out of range</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: or see<span class=apple-converted-space> </span><a href="https://petsc.org/release/faq/#valgrind"><span style='color:purple'>https://petsc.org/release/faq/#valgrind</span></a><span class=apple-converted-space> </span>and<span class=apple-converted-space> </span><a href="https://petsc.org/release/faq/"><span style='color:purple'>https://petsc.org/release/faq/</span></a></span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: The line numbers in the error traceback are not always exact.</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #1 BLASdot()</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #2 VecNorm_Seq() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\latest\src\vec\vec\impls\seq\bvec2.c:213</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #3 VecNorm() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\latest\src\vec\vec\interface\rvector.c:237</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #4 VecNormalize() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\latest\src\vec\vec\interface\rvector.c:318</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #5 KSPGMRESCycle() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\latest\src\ksp\ksp\impls\gmres\gmres.c:110</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #6 KSPSolve_GMRES() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\latest\src\ksp\ksp\impls\gmres\gmres.c:227</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #7 KSPSolve_Private() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\latest\src\ksp\ksp\interface\itfunc.c:898</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0]PETSC ERROR: #8 KSPSolve() at D:\Users\bbwannabe\Documents\Petsc\latest\src\ksp\ksp\interface\itfunc.c:1070</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>job aborted:</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[ranks] message</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'> </span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>[0] application aborted</span><o:p></o:p></p></div></div><div><div><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif"'>aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 59, comm rank 0</span><o:p></o:p></p></div></div></div></div></div></div></div><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p></div></div></body></html>