<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Tue, Jun 27, 2023 at 11:23 AM Vanella, Marcos (Fed) <<a href="mailto:marcos.vanella@nist.gov">marcos.vanella@nist.gov</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="msg-3817469500869486181">




<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Hi Mark and Matt, I tried swapping the preconditioner to cholmod and also the hypre Boomer AMG. They work just fine for my case. I also got my hands on a machine with NVIDIA gpus in one of our AI clusters. I compiled PETSc to make use of cuda and cuda-enabled
 openmpi (with gcc).</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I'm running the previous tests and want to also check some of the cuda enabled solvers. I was able to submit a case for the default Krylov solver with these runtime flags: -vec_type seqcuda -mat_type seqaijcusparse -pc_type cholesky -pc_factor_mat_solver_type
 cusparse. The case run to completion.</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I guess my question now is how do I monitor (if there is a way) that the GPU is being used in the calculation, and any other stats?</div></div></div></blockquote><div><br></div><div>You should get that automatically with</div><div><br></div><div>  -log_view</div><div><br></div><div>If you want finer-grained profiling of the kernels, you can use</div><div><br></div><div>  -log_view_gpu_time</div><div><br></div><div>but it can slows things down.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="msg-3817469500869486181"><div dir="ltr"><div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)"> Also, which other solver combination using GPU would you recommend for me to try? Can we compile PETSc with the cuda enabled
 version for CHOLMOD and HYPRE?</div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Hypre has GPU support but not CHOLMOD. There are no rules of thumb right now for GPUs. It depends on what card you have, what version of the driver, what version of the libraries, etc. It is very fragile. Hopefully this period ends soon, but I am not optimistic. Unless you are very confident that GPUs will help,</div><div>I would not recommend spending the time.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="msg-3817469500869486181"><div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Thank you for your help!</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Marcos <br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div id="m_-3817469500869486181appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div id="m_-3817469500869486181divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>><br>
<b>Sent:</b> Monday, June 26, 2023 12:11 PM<br>
<b>To:</b> Vanella, Marcos (Fed) <<a href="mailto:marcos.vanella@nist.gov" target="_blank">marcos.vanella@nist.gov</a>><br>
<b>Cc:</b> Mark Adams <<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank">mfadams@lbl.gov</a>>; <a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a>><br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] SOLVE + PC combination for 7 point stencil (unstructured) poisson solution</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">On Mon, Jun 26, 2023 at 12:08 PM Vanella, Marcos (Fed) via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
</div>
<div>
<blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Than you Matt and Mark, I'll try your suggestions. To configure with hypre can I just use the --download-hypre configure line?</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>Yes,</div>
<div><br>
</div>
<div>  Thanks,</div>
<div><br>
</div>
<div>    Matt</div>
<div> </div>
<blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
That is what I did with suitesparse, very nice.<br>
</div>
<div id="m_-3817469500869486181x_m_-5320235529926307471appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div id="m_-3817469500869486181x_m_-5320235529926307471divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Mark Adams <<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank">mfadams@lbl.gov</a>><br>
<b>Sent:</b> Monday, June 26, 2023 12:05 PM<br>
<b>To:</b> Vanella, Marcos (Fed) <<a href="mailto:marcos.vanella@nist.gov" target="_blank">marcos.vanella@nist.gov</a>><br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a>><br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] SOLVE + PC combination for 7 point stencil (unstructured) poisson solution</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">I'm not sure what MG is doing with an "unstructured" problem. I assume you are not using DMDA. 
<div>-pc_type gamg should work <br>
</div>
<div>I would configure with hypre and try that also: -pc_type hypre</div>
<div><br>
</div>
<div>As Matt said MG should be faster. How many iterations was it taking?</div>
<div>Try a 100^3 and check that the iteration count does not change much, if at all.</div>
<div><br>
</div>
<div>Mark</div>
<div><br>
</div>
</div>
<br>
<div>
<div dir="ltr">On Mon, Jun 26, 2023 at 11:35 AM Vanella, Marcos (Fed) via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
</div>
<blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Hi, I was wondering if anyone has experience on what combinations are more efficient to solve a Poisson problem derived from a 7 point stencil on a single mesh (serial).</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I've been doing some tests of multigrid and cholesky on a 50^3 mesh. <b>-pc_type mg</b> takes about 75% more time than
<b>-pc_type cholesky -pc_factor_mat_solver_type cholmod</b> for the case I'm testing.</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I'm new to PETSc so any suggestions are most welcome and appreciated,</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Marcos<br>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
<span>-- </span><br>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener</div>
<div><br>
</div>
<div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>

</div></blockquote></div><br clear="all"><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>