<div dir="ltr">Unfortunately, I can modify ex2 to perform the matrix fill in using only one rank, although I have understood how it works.<div>Is it so hard to do that?<br><br>Thank you.<br><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Em qua., 21 de jun. de 2023 às 12:20, Mark Adams <<a href="mailto:mfadams@lbl.gov">mfadams@lbl.gov</a>> escreveu:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">ex2 looks the same as the code at the beginning of the thread, which looks fine to me, yet fails.<br><div>(the only thing I can think of is that &<a href="http://v.at" target="_blank">v.at</a>(i) is not doing what one wants)</div><div><br></div><div>Diego: I would start with this ex2.c, add your view statement, verify; incrementally change ex2 to your syntax and see where it breaks.</div><div><br></div><div>Mark</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Jun 21, 2023 at 9:50 AM Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr">On Wed, Jun 21, 2023 at 9:22 AM Diego Magela Lemos <<a href="mailto:diegomagela@usp.br" target="_blank">diegomagela@usp.br</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Please, could you provide a minimal working example (or link) of how to do this?<br></div></blockquote><div><br></div><div>You can see here</div><div><br></div><div>  <a href="https://petsc.org/main/src/ksp/ksp/tutorials/ex2.c.html" target="_blank">https://petsc.org/main/src/ksp/ksp/tutorials/ex2.c.html</a></div><div><br></div><div>that each process only sets values for the rows it owns.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Thank you.<br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Em ter., 20 de jun. de 2023 às 15:08, Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>> escreveu:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr">On Tue, Jun 20, 2023 at 2:02 PM Diego Magela Lemos <<a href="mailto:diegomagela@usp.br" target="_blank">diegomagela@usp.br</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">So... what do I need to do, please?<br>Why am I getting wrong results when solving the linear system if the matrix is filled in with <font face="monospace">MatSetPreallocationCOO</font> and <font face="monospace">MatSetValuesCOO?</font></div></blockquote><div><br></div><div>It appears that you have _all_ processes submit _all_ triples (i, j, v). Each triple can only be submitted by a single process. You can fix this in many ways. For example, an easy but suboptimal way is just to have process 0 submit them all, and all other processes submit nothing.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>  Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Em ter., 20 de jun. de 2023 às 14:56, Jed Brown <<a href="mailto:jed@jedbrown.org" target="_blank">jed@jedbrown.org</a>> escreveu:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>> writes:<br>
<br>
>> The matrix entries are multiplied by 2, that is, the number of processes<br>
>> used to execute the code.<br>
>><br>
><br>
> No. This was mostly intended for GPUs, where there is 1 process. If you<br>
> want to use multiple MPI processes, then each process can only introduce<br>
> some disjoint subset of the values. This is also how MatSetValues() works,<br>
> but it might not be as obvious.<br>
<br>
They need not be disjoint, just sum to the expected values. This interface is very convenient for FE and FV methods. MatSetValues with ADD_VALUES has similar semantics without the intermediate storage, but it forces you to submit one element matrix at a time. Classic parallelism granularity versus memory use tradeoff with MatSetValuesCOO being a clear win on GPUs and more nuanced for CPUs.<br>
</blockquote></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div>