<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Wed, May 31, 2023 at 6:34 AM Joauma Marichal <<a href="mailto:joauma.marichal@uclouvain.be">joauma.marichal@uclouvain.be</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="msg2909780015981468163">





<div lang="FR-BE" style="overflow-wrap: break-word;">
<div class="m_2909780015981468163WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">Hello,
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">Thanks a lot, it worked. However my code does not compile anymore (I haven’t changed anything since yesterday and it worked then). I get the following error:</span></p></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>It looks like your Homebrew has changed. In particular, the gcc 12.2.0 is missing, and presumably that is where libgfortran was.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="msg2909780015981468163"><div lang="FR-BE" style="overflow-wrap: break-word;"><div class="m_2909780015981468163WordSection1">
<p class="m_2909780015981468163p1"><span class="m_2909780015981468163apple-converted-space"><span lang="EN-US"> </span></span><span class="m_2909780015981468163s1"><span lang="EN-US">-L/opt/homebrew/Cellar/gcc/12.2.0/lib/gcc/current -lpetsc -lHYPRE -lflapack -lfblas -lc++ -lmpifort -lmpi -lpmpi -lgfortran -lemutls_w -lquadmath
 -lc++</span></span><span lang="EN-US"><u></u><u></u></span></p>
<p class="m_2909780015981468163p1"><span class="m_2909780015981468163s1"><span lang="EN-US">ld: warning: directory not found for option '-L/opt/homebrew/Cellar/mpich/4.1/lib'</span></span><span lang="EN-US"><u></u><u></u></span></p>
<p class="m_2909780015981468163p1"><span class="m_2909780015981468163s1"><span lang="EN-US">ld: warning: directory not found for option '-L/opt/homebrew/Cellar/gcc/12.2.0/lib/gcc/current/gcc/aarch64-apple-darwin22/12'</span></span><span lang="EN-US"><u></u><u></u></span></p>
<p class="m_2909780015981468163p1"><span class="m_2909780015981468163s1"><span lang="EN-US">ld: warning: directory not found for option '-L/opt/homebrew/Cellar/gcc/12.2.0/lib/gcc/current/gcc'</span></span><span lang="EN-US"><u></u><u></u></span></p>
<p class="m_2909780015981468163p1"><span class="m_2909780015981468163s1"><span lang="EN-US">ld: warning: directory not found for option '-L/opt/homebrew/Cellar/gcc/12.2.0/lib/gcc/current'</span></span><span lang="EN-US"><u></u><u></u></span></p>
<p class="m_2909780015981468163p1"><span class="m_2909780015981468163s1"><span lang="EN-US">ld: library not found for -lgfortran</span></span><span lang="EN-US"><u></u><u></u></span></p>
<p class="m_2909780015981468163p1"><span class="m_2909780015981468163s1"><span lang="EN-US">clang: </span></span><span class="m_2909780015981468163s2"><b><span lang="EN-US">error:
</span></b></span><span class="m_2909780015981468163s1"><b><span lang="EN-US">linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)</span></b></span><span lang="EN-US"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">I attach the complete log file.
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">Thanks a lot for your help.
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">Best regards,
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">Joauma<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
<div style="border-right:none;border-bottom:none;border-left:none;border-top:1pt solid rgb(181,196,223);padding:3pt 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12pt"><b><span style="font-size:12pt;color:black">De :
</span></b><span style="font-size:12pt;color:black">Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>><br>
<b>Date : </b>mercredi, 31 mai 2023 à 12:03<br>
<b>À : </b>Joauma Marichal <<a href="mailto:joauma.marichal@uclouvain.be" target="_blank">joauma.marichal@uclouvain.be</a>><br>
<b>Cc : </b>PETSc <<a href="mailto:petsc-maint@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-maint@mcs.anl.gov</a>>, <a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a>><br>
<b>Objet : </b>Re: [petsc-maint] Error during compile<u></u><u></u></span></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt">On Wed, May 31, 2023 at 5:25 AM Joauma Marichal <<a href="mailto:joauma.marichal@uclouvain.be" target="_blank">joauma.marichal@uclouvain.be</a>> wrote:<u></u><u></u></span></p>
</div>
<div>
<blockquote style="border-top:none;border-right:none;border-bottom:none;border-left:1pt solid rgb(204,204,204);padding:0cm 0cm 0cm 6pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0cm">
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">Hello,</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">I am writing to you as I am trying to compile petsc on my mac.
</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt">I used:
</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;color:rgb(33,33,33)">$ export PATH=/opt/homebrew/bin:/opt/homebrew/sbin:/usr/local/bin:/System/Cryptexes/App/usr/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/Library/TeX/texbin:/usr/local/munki</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;color:rgb(33,33,33)">$ ./configure --download-fblaslapack --download-hypre --prefix=../marha/lib_</span><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;color:rgb(7,7,6);background:rgb(255,237,148)">petsc</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt">This is a bug in make 4.4.1. Either upgrade to the latest PETSc release or<u></u><u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt">  make OMAKE_PRINTDIR=make all<u></u><u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt">  Thanks,<u></u><u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt">     Matt<u></u><u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"> <u></u><u></u></span></p>
</div>
<blockquote style="border-top:none;border-right:none;border-bottom:none;border-left:1pt solid rgb(204,204,204);padding:0cm 0cm 0cm 6pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0cm">
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;color:rgb(7,7,6);background:rgb(255,237,148)">Which has worked previously but today, I get:</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;color:rgb(7,7,6);background:rgb(255,237,148)"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336p1"><span class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336s1"><b><span lang="EN-US">**************************ERROR*************************************</span></b></span><u></u><u></u></p>
<p class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336p1"><span class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336apple-converted-space"><b><span lang="EN-US"> 
</span></b></span><span class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336s1"><b><span lang="EN-US">Error during compile, check arch-darwin-c-debug/lib/petsc/conf/make.log</span></b></span><u></u><u></u></p>
<p class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336p1"><span class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336apple-converted-space"><b><span lang="EN-US"> 
</span></b></span><span class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336s1"><b><span lang="EN-US">Send it and arch-darwin-c-debug/lib/petsc/conf/configure.log to
</span><a href="mailto:petsc-maint@mcs.anl.gov" target="_blank"><span lang="EN-US">petsc-maint@mcs.anl.gov</span></a></b></span><u></u><u></u></p>
<p class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336p1"><span class="m_2909780015981468163m-1386416774045177336s1"><b><span lang="EN-US">********************************************************************</span></b></span><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,33,33)"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,33,33)"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,33,33)">I attach the files.
<br>
<br>
Thanks a lot for your help. </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,33,33)"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,33,33)">Best regards,
</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,33,33)"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,33,33)">Joauma</span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt"> </span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><br clear="all">
<u></u><u></u></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span class="m_2909780015981468163gmailsignatureprefix"><span style="font-size:11pt">--
</span></span><span style="font-size:11pt"><u></u><u></u></span></p>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener<u></u><u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt"><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><u></u><u></u></span></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>

</div></blockquote></div><br clear="all"><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>