<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>

</head>

<body dir="ltr">

<div><a class="reference external elementToProof"></a></div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

Hi everyone, <br>

</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

<br>

</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

I am a new Petsc user that incorporates Petsc for FEM in a Fortran code. <br>

</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

My question concerns the sudden increase of the memory that Petsc needs during the assembly of the jacobian matrix. After this point, memory is freed. It seems to me like Petsc performs memory allocations and the deallocations during assembly.

<br>

</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

I have used the following commands with no success: <br>

</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

CALL MatSetOption(petsc_A, MAT_NEW_NONZERO_LOCATIONS,PETSC_FALSE,ier)

<div class="ContentPasted0">CALL MatSetOption(petsc_A, MAT_NEW_NONZERO_LOCATION_ERR,PETSC_TRUE,ier)</div>

CALL MatSetOption(petsc_A, MAT_NEW_NONZERO_ALLOCATION_ERR, PETSC_TRUE,ier).</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0 ContentPasted1" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

CALL MatSetOption(petsc_A, MAT_KEEP_NONZERO_PATTERN,PETSC_TRUE,ier)</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0 ContentPasted1" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

<br>

</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

The structure of the matrix does not change during my simulation, just the values. I am expecting this behavior the first time that I create this matrix because the preallocation instructions that I use are not very accurate but this continues every time I

 assemble the matrix.</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0 ContentPasted2" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

What I am missing here?</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0 ContentPasted2" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

<br>

</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0 ContentPasted2" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

Thank you very much, <br>

</div>

<div class="elementToProof ContentPasted0 ContentPasted2" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

Pantelis <br>

</div>

</body>

</html>