<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
My code uses TS to solve a set of multi-fluid MHD equations. The jacobian is provided with function F(t, u, u'). Both linear and nonlinear solvers converge but snes repeats itself until gets "TSStep has failed due to diverged_step_rejected."
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
Is it because I used TSStep rather than TSSolve? I have checked the condition number. The condition number with pc_type asm is about 1 (without precondition it is about 4x10^4). The maximum ratio of off-diagonal jacobian element over diagonal element is about
 21.</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
Could you help me to identify what is going wrong?</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
Thank you very much!</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
Jiannan<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
---------------------------------------------------------------------------------------------------<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
Run command with options<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<div style="color:#333333;background-color:#f5f5f5;font-family:'Droid Sans Mono', 'monospace', monospace;font-weight:normal;font-size:14px;line-height:19px">
<span><span class="ContentPasted1">mpiexec -n </span><span style="color:#777777" class="ContentPasted1">$</span><span style="color:#7a3e9d" class="ContentPasted1">1</span><span class="ContentPasted1"> ./iditm3d -ts_type arkimex -snes_tyep ngmres -ksp_type gmres
 -pc_type asm \</span></span></div>
<div style="color:#333333;background-color:#f5f5f5;font-family:'Droid Sans Mono', 'monospace', monospace;font-weight:normal;font-size:14px;line-height:19px">
<div><span class="ContentPasted1">-ts_rtol 1.0e-4 -ts_atol 1.0e-4 -snes_monitor -snes_rtol 1.0e-4 -snes_atol 1.0e-4 \</span></div>
<span><span class="ContentPasted1">-snes_converged_reason</span></span></div>
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
The output message is </div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="elementToProof ContentPasted0 ContentPasted3">
<div style="color:#333333;background-color:#f5f5f5;font-family:'Droid Sans Mono', 'monospace', monospace;font-weight:normal;font-size:14px;line-height:19px">
<span><span class="ContentPasted2"></span></span></div>
Start time advancing ...
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.673091274668e-03 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 8.715428433630e-02 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 4.995727626692e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">    2 SNES Function norm 5.498018152230e-08 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 2</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.237461568254e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 7.988531005091e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">    2 SNES Function norm 1.280948196292e-07 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 2</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 4.881903203545e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 7.562592690785e-02 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.143078818923e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">    2 SNES Function norm 9.834547907735e-09 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 2</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.683968949758e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.838028436639e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">    2 SNES Function norm 9.470813523140e-09 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 2</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.821562431175e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 1.005443458812e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 3.633336946661e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 1.515368382715e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 3.389298316830e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 4.541003359206e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 1.713800906043e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.179958172167e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.020265094117e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.513971290464e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 6.090269704320e-06 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.136603895703e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.877474016012e-06 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.127812462507e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.713146825704e-06 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.793512213059e-06 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.205196267430e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.572653773308e-06 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.260057361977e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.705816087598e-06 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.764855860446e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.212505522844e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.958996472386e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.273222034162e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.994512887620e-05 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_ABS iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072186e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 3.317240589134e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.213246532918e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.799468604767e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.274570888397e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 3.066048050994e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072189e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.653507278572e-03 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.213869585841e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.177156902895e-03 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.275136370365e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.962849131557e-03 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473072218e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 5.664907315679e-03 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.223208399368e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 5.688863091415e-03 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.287121218919e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 4.085338521320e-03 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.274473071968e+03 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 4.694691905235e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_FNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 2.211786508657e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 1.503497433939e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">    0 SNES Function norm 3.272667798977e-01 </div>
<div class="ContentPasted3">    1 SNES Function norm 2.176132327279e-04 </div>
<div class="ContentPasted3">  Nonlinear solve converged due to CONVERGED_SNORM_RELATIVE iterations 1</div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------</div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR:   </div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR: TSStep has failed due to DIVERGED_STEP_REJECTED</div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR: See https://petsc.org/release/faq/ for trouble shooting.</div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.16.6, Mar 30, 2022
</div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR: ./iditm3d on a  named office by jtu Fri Feb 17 11:59:43 2023</div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR: Configure options --prefix=/usr/local --with-mpi-dir=/usr/local --with-fc=0 --with-openmp --with-hdf5-dir=/usr/local --download-f2cblaslapack=1</div>
<div class="ContentPasted3">[0]PETSC ERROR: #1 TSStep() at /home/jtu/Downloads/petsc-3.16.6/src/ts/interface/ts.c:3583</div>
<br>
</div>
</body>
</html>