<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Tue, Jul 12, 2022 at 1:50 AM Ce Qin <<a href="mailto:qince168@gmail.com">qince168@gmail.com</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Thanks for your quick response.<div><br></div><div>The linear system is complex-valued. We rewrite it into its real form</div><div>and solve it using FGMRES and an optimal block-diagonal preconditioner. </div><div>We use CG and the AMS preconditioner implemented in HYPRE to solve the</div><div>smaller real linear system arised from applying the block preconditioner.</div><div>The iteration number of FGMRES and CG keep almost constant in all the runs.</div></div></blockquote><div><br></div><div>So those blocks decrease in size as you add more processes?</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Each node is equipped with a 64-core CPU and 128 GB of memory.</div><div>The matrix-vector production is memory-bandwidth limited. Is this strange behavior</div><div>related to memory bandwidth?</div></div></blockquote><div><br></div><div>I don't see how.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Best,</div><div>Ce</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Mark Adams <<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank">mfadams@lbl.gov</a>> 于2022年7月12日周二 04:04写道:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Also, cache effects. 20M DoFs on one core/thread is huge.<div>37x on assembly is probably cache effects.</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Jul 11, 2022 at 1:09 PM Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr">On Mon, Jul 11, 2022 at 10:34 AM Ce Qin <<a href="mailto:qince168@gmail.com" target="_blank">qince168@gmail.com</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>I want to analyze the strong scaling of our in-house FEM code.</div><div>The test problem has about 20M DoFs. I ran the problem using</div><div>various settings. The speedups for the assembly and solving</div><div>procedures are as follows:</div><div><div><font face="monospace">                                   Assembly     Solving</font></div><div><font face="monospace">NProcessors NNodes CoresPerNode                        </font></div><div><font face="monospace">1           1      1                    1.0         1.0</font></div><div><font face="monospace">2           1      2               1.995246    1.898756</font></div><div><font face="monospace">            2      1               2.121401    2.436149</font></div><div><font face="monospace">4           1      4               4.658187    6.004539</font></div><div><font face="monospace">            2      2               4.666667    5.942085</font></div><div><font face="monospace">            4      1                4.65272    6.101214</font></div><div><font face="monospace">8           2      4               9.380985   16.581135</font></div><div><font face="monospace">            4      2               9.308575   17.258891</font></div><div><font face="monospace">            8      1               9.314449   17.380612</font></div><div><font face="monospace">16          2      8              18.575953   34.483058</font></div><div><font face="monospace">            4      4              18.745129   34.854409</font></div><div><font face="monospace">            8      2              18.828393    36.45509</font></div><div><font face="monospace">32          4      8              37.140626   70.175879</font></div><div><font face="monospace">            8      4              37.166421   71.533865</font></div></div><div><font face="monospace"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif">I don't quite understand this result. Why we can achieve</font><font face="arial, sans-serif"> a speedup of</font></div><div><font face="arial, sans-serif">about </font><span style="font-family:arial,sans-serif">70+ using 32 processors? Could you please help me explain this?</span></div></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>We need more data. I would start with the number of iterates that the solver</div><div>executes. I suspect this is changing. However, it can be more complicated.</div><div>For example, a Block-Jacobi preconditioner gets cheaper as the number of</div><div>subdomains increases. Thus we need to know exactly what the solver is doing.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><font face="arial, sans-serif">Thank you in advance.</font></div><div><font face="arial, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif">Best,</font></div><div><font face="arial, sans-serif">Ce</font></div><div><font face="monospace"><br></font></div><div><font face="monospace"><br></font></div></div></div></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>