<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body>
<div class="moz-cite-prefix">Hi Mark,</div>
<div class="moz-cite-prefix">thanks for the answer, but I'm struggling to translate your suggestion into solver options.
<br>
</div>
<div class="moz-cite-prefix">From scrolling through the user manual I think this points towards PCCOMPOSITE.<br>
</div>
<div class="moz-cite-prefix">However, the User Manual is not very precise with composite PCs, so how would I achieve this on top of my existing solver options?</div>
<div class="moz-cite-prefix">Best regards</div>
<div class="moz-cite-prefix">Elias<br>
</div>
<div class="moz-cite-prefix"><br>
</div>
<div class="moz-cite-prefix"><br>
</div>
<div class="moz-cite-prefix"><br>
</div>
<div class="moz-cite-prefix">Am 06.07.22 um 16:41 schrieb Mark Adams:<br>
</div>
<blockquote type="cite" cite="mid:CADOhEh6GaPynnLG4GjZ19T7qJon47G6sqM_k2YvHHmfY8T2fgA@mail.gmail.com">
<div dir="ltr">And one iteration of undamped Jacobi after the solve should fix this.</div>
<br>
<div class="gmail_quote">
<div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Jul 6, 2022 at 8:42 AM Karabelas, Elias (<a href="mailto:elias.karabelas@uni-graz.at" moz-do-not-send="true">elias.karabelas@uni-graz.at</a>) <<a href="mailto:elias.karabelas@uni-graz.at" moz-do-not-send="true">elias.karabelas@uni-graz.at</a>>
 wrote:<br>
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px
          0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<div>Dear Matt,</div>
<div><br>
</div>
<div>thanks for the fast response. That makes perfect sense to me. <br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Best regards</div>
<div>Elias<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Am 06.07.22 um 14:35 schrieb Matthew Knepley:<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">On Wed, Jul 6, 2022 at 7:46 AM Karabelas, Elias (<a href="mailto:elias.karabelas@uni-graz.at" target="_blank" moz-do-not-send="true">elias.karabelas@uni-graz.at</a>) <<a href="mailto:elias.karabelas@uni-graz.at" target="_blank" moz-do-not-send="true">elias.karabelas@uni-graz.at</a>>
 wrote:<br>
</div>
<div class="gmail_quote">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px
                    0px 0.8ex;border-left:1px solid
                    rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<p><font size="4"><font face="monospace">Dear all,</font></font></p>
<p><font size="4"><font face="monospace">I don't know if this is a bug, but I observed that when using GMRES with AGG-PCGAMG as preconditioner Dirichlet boundary conditions don't seem to be exactly fulfilled.</font></font></p>
<p><font size="4"><font face="monospace">My Matrix has zero rows and cols with 1 on the diagonal where I have dirichlet-bcs in my FE-mesh and I would expect that the eqs in this rows can be exactly fulfilled (as u_i = g_i) there.</font></font></p>
</div>
</blockquote>
<div>I would not expect aggregation to be exact here, but only within the iteration tolerance. If instead you eliminate those variables, you can maintain algebraic exactness.</div>
<div>This is what we do in examples, like SNES ex56.</div>
<div><br>
</div>
<div>  Thanks,</div>
<div><br>
</div>
<div>     Matt</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px
                    0px 0.8ex;border-left:1px solid
                    rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<p><font size="4"><font face="monospace">However, when I solve A*x = b with the above solver I only get u_i = g_i + error in that part of the vector. Switching from pc_gamg_type agg to pc_gamg_type classical cures this problem, but the classical is not advertised
 in the user manual.</font></font></p>
<p>These are the options I'm currently using:</p>
<p>-ksp_type gmres<br>
-ksp_pc_side right<br>
-pc_type gamg<br>
-pc_gamg_type agg [or classical]<br>
-pc_gamg_sym_graph 1<br>
-pc_gamg_square_graph 1<br>
-pc_gamg_agg_nsmooths 1<br>
-pc_gamg_threshold 0.01<br>
-pc_mg_cycles v<br>
</p>
<p>Iteration counts are basically the same.</p>
<p>Best regards</p>
<p>Elias<br>
</p>
<pre cols="72">-- 
Dr. Elias Karabelas
Research Associate
University of Graz
Institute of Mathematics and Scientific Computing
Heinrichstraße 36
A-8010 Graz
Austria

Phone: +43 316 380 8546
Email: <a href="mailto:elias.karabelas@uni-graz.at" target="_blank" moz-do-not-send="true">elias.karabelas@uni-graz.at</a>
Web:  <a href="https://ccl.medunigraz.at/" target="_blank" moz-do-not-send="true">https://ccl.medunigraz.at/</a></pre>
</div>
</blockquote>
</div>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener</div>
<div><br>
</div>
<div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank" moz-do-not-send="true">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<p><br>
</p>
<pre cols="72">-- 
Dr. Elias Karabelas
Research Associate
University of Graz
Institute of Mathematics and Scientific Computing
Heinrichstraße 36
A-8010 Graz
Austria

Phone: +43 316 380 8546
Email: <a href="mailto:elias.karabelas@uni-graz.at" target="_blank" moz-do-not-send="true">elias.karabelas@uni-graz.at</a>
Web:  <a href="https://ccl.medunigraz.at/" target="_blank" moz-do-not-send="true">https://ccl.medunigraz.at/</a></pre>
</div>
</blockquote>
</div>
</blockquote>
<p><br>
</p>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Dr. Elias Karabelas
Research Associate
University of Graz
Institute of Mathematics and Scientific Computing
Heinrichstraße 36
A-8010 Graz
Austria

Phone: +43 316 380 8546
Email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:elias.karabelas@uni-graz.at">elias.karabelas@uni-graz.at</a>
Web:  <a class="moz-txt-link-freetext" href="https://ccl.medunigraz.at/">https://ccl.medunigraz.at/</a></pre>
</body>
</html>