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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Hi!</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
I have a Chorin pressure correction solver with consistent pressure update, i.e.</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
pressure solve is based on the Schur complement <br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
E = -A10*ainv(A00)*A01 <br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
with A10 = divergence, A00 the mass matrix and A01 the gradient.</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
I have had this implemented with petsc for a long time and it's working fine. However, I've done the schur-complement manually, ie using a MatShell.</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
I now wanted to see if I can implement this using the petsc facilities for the schur-complement, but I get a confusing error when I call MatSchurComplementGetPmat().</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
-----</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Code snippet:</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
 MatCreateSchurComplement(m_blocks[0], m_blocks[0], m_blocks[1], m_blocks[2], nullptr, &E_operator);</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
< ... setup the ksp for A00 ></div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
 MatSchurComplementSetAinvType(E_operator, MAT_SCHUR_COMPLEMENT_AINV_DIAG);</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
MatView(E_operator);</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
MatSchurComplementGetPmat(E_operator, MAT_INITIAL_MATRIX, &E_pc);</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
-----<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
This yields the output (I cut out the matrix elements):</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Mat Object: 1 MPI processes
<div>  type: schurcomplement</div>
<div>  Schur complement A11 - A10 inv(A00) A01</div>
<div>  A11 = 0</div>
<div>  A10</div>
<div>    Mat Object: 1 MPI processes</div>
      type: seqaij</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
 KSP of A00
<div>    KSP Object: 1 MPI processes</div>
<div>      type: preonly</div>
<div>      maximum iterations=1000, initial guess is zero</div>
<div>      tolerances:  relative=1e-06, absolute=1e-20, divergence=1e+06</div>
<div>      left preconditioning</div>
<div>      using DEFAULT norm type for convergence test</div>
<div>    PC Object: 1 MPI processes</div>
<div>      type: lu</div>
<div>        out-of-place factorization</div>
<div>        tolerance for zero pivot 2.22045e-14</div>
<div>        matrix ordering: nd</div>
<div>        factor fill ratio given 5., needed 1.02768</div>
<div>          Factored matrix follows:</div>
<div>            Mat Object: 1 MPI processes</div>
<div>              type: seqaij</div>
<div>              rows=72, cols=72</div>
<div>              package used to perform factorization: petsc</div>
<div>              total: nonzeros=4752, allocated nonzeros=4752</div>
<div>                using I-node routines: found 22 nodes, limit used is 5</div>
<div>      linear system matrix = precond matrix:</div>
<div>      Mat Object: 1 MPI processes</div>
<div>        type: seqaij</div>
<div>        rows=72, cols=72</div>
<div>        total: nonzeros=4624, allocated nonzeros=5184</div>
<div>        total number of mallocs used during MatSetValues calls=0</div>
<div>          using I-node routines: found 24 nodes, limit used is 5</div>
<div>  A01</div>
<div>    Mat Object: 1 MPI processes</div>
      type: seqaij</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
</div>
[0]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------
<div>[0]PETSC ERROR: Invalid argument</div>
<div>[0]PETSC ERROR: Wrong type of object: Parameter # 1</div>
<div>[0]PETSC ERROR: See https://petsc.org/release/faq/ for trouble shooting.</div>
<div>[0]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.17.2, Jun 02, 2022</div>
<div>[0]PETSC ERROR: ../d/bin/Stokes on a linux-gnu-cxx-opt named akvalung by akva Fri Jun  3 14:48:06 2022</div>
<div>[0]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi=0 --with-lapack-lib=-llapack --with-64-bit-indices=0 --with-shared-libraries=0 --COPTFLAGS=-O3 --CXXOPTFLAGS=-O3 --FOPTFLAGS=-O3 --with-blas-lib=-lblas --CFLAGS=-fPIC --CXXFLAGS=-fPIC --FFLAGS=-fPIC</div>
<div>[0]PETSC ERROR: #1 MatDestroy() at /home/akva/kode/petsc/petsc-3.17.2/src/mat/interface/matrix.c:1235</div>
<div>[0]PETSC ERROR: #2 MatCreateSchurComplementPmat() at /home/akva/kode/petsc/petsc-3.17.2/src/ksp/ksp/utils/schurm/schurm.c:763</div>
<div>[0]PETSC ERROR: #3 MatSchurComplementGetPmat_Basic() at /home/akva/kode/petsc/petsc-3.17.2/src/ksp/ksp/utils/schurm/schurm.c:785</div>
[0]PETSC ERROR: #4 MatSchurComplementGetPmat() at /home/akva/kode/petsc/petsc-3.17.2/src/ksp/ksp/utils/schurm/schurm.c:835
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
where the errors come from the call call to obtain the preconditioner matrix.</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
I don't see what I've done wrong, as far as I can see it's all following <a href="https://petsc.org/release/docs/manualpages/KSP/MatCreateSchurComplement.html#MatCreateSchurComplement" id="LPlnkOWALinkPreview">
https://petsc.org/release/docs/manualpages/KSP/MatCreateSchurComplement.html#MatCreateSchurComplement</a><br>
</div>
<div class="_Entity _EType_OWALinkPreview _EId_OWALinkPreview _EReadonly_1">
<div id="LPBorder_GTaHR0cHM6Ly9wZXRzYy5vcmcvcmVsZWFzZS9kb2NzL21hbnVhbHBhZ2VzL0tTUC9NYXRDcmVhdGVTY2h1ckNvbXBsZW1lbnQuaHRtbCNNYXRDcmVhdGVTY2h1ckNvbXBsZW1lbnQ." class="LPBorder689672" style="width: 100%; margin-top: 16px; margin-bottom: 16px; position: relative; max-width: 800px; min-width: 424px;">
<table id="LPContainer689672" role="presentation" style="padding: 12px 36px 12px 12px; width: 100%; border-width: 1px; border-style: solid; border-color: rgb(200, 200, 200); border-radius: 2px;">
<tbody>
<tr style="border-spacing: 0px;" valign="top">
<td style="width: 100%;">
<div id="LPTitle689672" style="font-size: 21px; font-weight: 300; margin-right: 8px; font-family: "wf_segoe-ui_light", "Segoe UI Light", "Segoe WP Light", "Segoe UI", "Segoe WP", Tahoma, Arial, sans-serif; margin-bottom: 12px;">
<a target="_blank" id="LPUrlAnchor689672" href="https://petsc.org/release/docs/manualpages/KSP/MatCreateSchurComplement.html#MatCreateSchurComplement" style="text-decoration: none; color: var(--themePrimary);">MatCreateSchurComplement - Argonne National Laboratory</a></div>
<div id="LPDescription689672" style="font-size: 14px; max-height: 100px; color: rgb(102, 102, 102); font-family: "wf_segoe-ui_normal", "Segoe UI", "Segoe WP", Tahoma, Arial, sans-serif; margin-bottom: 12px; margin-right: 8px; overflow: hidden;">
Notes The Schur complement is NOT explicitly formed! Rather, this function returns a virtual Schur complement that can compute the matrix-vector product by using formula S = A11 - A10 A^{-1} A01 for Schur complement S and a KSP solver to approximate the action
 of A^{-1}.. All four matrices must have the same MPI communicator.</div>
<div id="LPMetadata689672" style="font-size: 14px; font-weight: 400; color: rgb(166, 166, 166); font-family: "wf_segoe-ui_normal", "Segoe UI", "Segoe WP", Tahoma, Arial, sans-serif;">
petsc.org</div>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<div id="LPCloseButtonContainer689672" class="BteeS" tabindex="0" title="Fjern forhåndsvisning av kobling" role="button">
<i data-icon-name="Cancel" aria-hidden="true" id="LPCloseButton689672" class="w6wS4 root-359"></i></div>
</div>
</div>
<br>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
and</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
 <a href="https://petsc.org/release/docs/manualpages/KSP/MatSchurComplementGetPmat.html#MatSchurComplementGetPmat" id="LPlnk182379">https://petsc.org/release/docs/manualpages/KSP/MatSchurComplementGetPmat.html#MatSchurComplementGetPmat</a></div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Looking into the code it seems to try to call MatDestroy() for the Sp matrix but as Sp has not been set up it fails (schurm.c:763)</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Removing that call as a test, it seems to succeed and I get the same solution as I do</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
with my manual code.<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
I'm sure I have done something stupid but I cannot see what, so any pointers would be appreciated.</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
cheers</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
arnem<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
</body>
</html>