<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Wed, Feb 9, 2022 at 10:15 PM Fillion-Gourdeau, Francois <<a href="mailto:francois.fillion@inrs.ca">francois.fillion@inrs.ca</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div id="gmail-m_9165412081518316225divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<p>Dear developers,</p>
<p>I have a mesh with topological dimension 2 (with triangular faces) embedded in a 3D space stored in a hdf5 file. This file contains the coordinates (x,y,z) of each vertex and also, it contains a list of vertices that make each element. I was able to read
 the mesh into a DMPlex using <span>DMPlexCreateFromFile (without interpolation, i.e. <span>interpolate</span>=PETSC_FALSE ). When I do this, the elements are stored at stratum height 0 and the vertices are stored at stratum height 1 (as checked via <span>DMPlexGetHeightStratum</span>).
 However, when I interpolate the mesh (<span><span>interpolate</span>=PETSC_TRUE</span>), it seems that some entities are created in stratum height 2 and 3. From my understanding of DMPlex, this should not happen for 2D elements because there are edges but
 no 3D cells. <br>
</span></p>
<p><span><br>
</span></p>
<p><span>Does DMPlex assume that the mesh in 3D has a topological dimension 3 and is it possible to use 2D mesh embeded in 3D space?</span></p></div></div></blockquote><div>No, the coordinate dimension should not affect the topological dimension. Can you send me the mesh you want to read? It would be best to send the smallest</div><div>one that fails.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div id="gmail-m_9165412081518316225divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<p><span>Best regards<br>
</span></p>
<p><br>
</p>
<div id="gmail-m_9165412081518316225Signature">
<div><font size="2">
<div>François Fillion-Gourdeau, PhD<br>
INRS-EMT</div>
</font></div>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>