<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>

</head>

<body dir="ltr">

<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

Hello,</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

<br>

</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

I want to solve a time dependent differential equation in 3D (Scalar field theory in Hamilton formulation) .</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

The crucial part is that at some time steps I need to FFT the 3D grid.</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

<br>

</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

I have written a sequential code without petsc and now I would like to use petsc to get a parallel version.

</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

I worked through the examples and now I understand DMDACreate and also the FFTW examples.</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

<br>

</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

What is missing though is how I combine both!</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

DMDACreate takes care of ghost points and periodic boundary conditions. As far as I know FFTW requires each process to have a slab of the grid to work. I know how to create this grid with DMDACreate. Normally I would proceed by creating a global vector by DMCreateGlobalVector.

 But this vector needs then to be linked with fftw arrays. How does this work?</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

Or should I first allocate local memory for fftw and then somehow stitch them together to form a global petsc vector?

</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

<br>

</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

Thanks</p>

<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%;background:transparent none repeat scroll 0% 0%">

best, gerhard </p>

<br>

</div>

</body>

</html>