<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><meta name=Generator content="Microsoft Word 15 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:DengXian;
        panose-1:2 1 6 0 3 1 1 1 1 1;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@DengXian";
        panose-1:2 1 6 0 3 1 1 1 1 1;}
@font-face
        {font-family:Menlo;
        panose-1:2 11 6 9 3 8 4 2 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
p.p1, li.p1, div.p1
        {mso-style-name:p1;
        margin:0cm;
        font-size:8.5pt;
        font-family:Menlo;
        color:black;}
span.s1
        {mso-style-name:s1;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:12.0pt;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=EN-CA link="#0563C1" vlink="#954F72" style='word-wrap:break-word'><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'>Dear PETSc developers and users,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'>I am trying to install the latest PETSc version on an ancient cluster. The OpenMPI version is 1.6.5 and Compiler is Intel 14.0, which are the newest on that cluster. I have no problem to install PETSc up to version 3.12.5. However, if I try to use PETSc 3.13+, there are three undefined reference errors in MPI_Win_allocate, MPI_Win_attach and MPI_Win_create_dynamic. I know these three functions are available from OpenMPI 2.0+. Because the cluster is not in technical support anymore, there is no way I can install new OpenMPI version or do some update. Is it possible to disable these three functions in PETSc 3.13+ version?<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'>The errors occur in ‘make check’ step:<o:p></o:p></span></p><p class=p1><span class=s1>/home/dsu/soft/petsc/petsc-3.13.0/linux-intel-openmpi/lib/libpetsc.so: undefined reference to `MPI_Win_allocate'</span><o:p></o:p></p><p class=p1><span class=s1>/home/dsu/soft/petsc/petsc-3.13.0/linux-intel-openmpi/lib/libpetsc.so: undefined reference to `MPI_Win_attach'</span><o:p></o:p></p><p class=p1><span class=s1>/home/dsu/soft/petsc/petsc-3.13.0/linux-intel-openmpi/lib/libpetsc.so: undefined reference to `MPI_Win_create_dynamic'</span><o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'>The configuration used is shown below:<o:p></o:p></span></p><p class=p1><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt'> </span><span class=s1>./configure --with-cc=mpicc --with-cxx=mpicxx --with-fc=mpif90 --download-mumps --download-scalapack --download-parmetis --download-metis --download-fblaslapack --download-hypre --download-superlu --download-hdf5=yes --with-debugging=0 COPTFLAGS="-O3 -march=native -mtune=native" CXXOPTFLAGS="-O3 -march=native -mtune=native" FOPTFLAGS="-O3 -march=native -mtune=nativels"</span><o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt'>Thanks,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt'>Danyang<o:p></o:p></span></p></div></body></html>