<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Wed, Mar 3, 2021 at 4:23 PM Smit  Thijs <<a href="mailto:thijs.smit@hest.ethz.ch">thijs.smit@hest.ethz.ch</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">





<div lang="EN-GB" style="overflow-wrap: break-word;">
<div class="gmail-m_-551227300792491839WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi All,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">I would like to readin a fairly large external vector into PETSc to be used further. My idea was to write a hdf5 file using Python with the vector data. Then read that hdf5 file into PETSc using PetscViewerHDF5Open and VecLoad. Is this
 the advised way or is there a better alternative to achieve the same (getting this external array data into PETSc)?</p></div></div></blockquote><div><br></div><div>I think there are at least two nice ways to do this:</div><div><br></div><div>1) Use HDF5. Here you have to name your vector to match the HDF5 object</div><div><br></div><div>2) Use raw binary. This is a specific PETSc format, but it is fast and simple.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Matt</div><div>  </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div lang="EN-GB" style="overflow-wrap: break-word;"><div class="gmail-m_-551227300792491839WordSection1"><p class="MsoNormal"><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(36,41,46)">Best regards,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(36,41,46)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(36,41,46)">Thijs Smit<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(36,41,46)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(36,41,46)">PhD Candidate<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(36,41,46)">ETH Zurich<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(36,41,46)">Institute for Biomechanics<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="DE-CH"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
</div>

</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>