<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Wed, Feb 10, 2021 at 4:07 AM Edoardo alinovi <<a href="mailto:edoardo.alinovi@gmail.com">edoardo.alinovi@gmail.com</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>Hello PETSc friends,</div><div><br></div><div>I am working on a code to partition a mesh in parallel and I am looking at parmetis. As far as I know petsc is interfaced with metis and parmetis and I have seen people using it within dmplex. Now, I am not using dmplex, but  I have petsc compiled along with my code for the linear system part.  I am wondering if there is a way to load up a mesh file in the parmetis format and use petsc to get the elements partitioning only in output. Is that possible?</div></div></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>ParMetis does not really have a mesh format. It partitions distributed graphs. Most people want to partition cells in their mesh, and</div><div>then ParMetis would want the graph for cell connectivity. This is not usually what people store, so typically there is a conversion process</div><div>here. If you want to use PETSc for partitioning, and not use DMPlex, the easiest way to do it is to put your cell connectivity in a Mat,</div><div>storing the adjacency graph for cells. Then use MatPartitioning.</div><div><br></div><div> Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>Thank you for the help,</div><div><br></div><div>Edoardo</div></div></div></div></div></blockquote></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>