<div dir="ltr">Thanks, Matt and Satish! Everything seems like it's working now.<br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sat, Oct 3, 2020 at 8:34 AM Satish Balay <<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov">balay@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Can use 'git status' to figure out what files are not in the repo.<br>
<br>
And a 'git clean -f -d -x' will delete everything except for the files in the repo [so use with care].<br>
<br>
Satish<br>
<br>
On Sat, 3 Oct 2020, Matthew Knepley wrote:<br>
<br>
> On Sat, Oct 3, 2020 at 11:11 AM Zane Charles Jakobs <<br>
> <a href="mailto:Zane.Jakobs@colorado.edu" target="_blank">Zane.Jakobs@colorado.edu</a>> wrote:<br>
> <br>
> > Hi PETSc devs,<br>
> ><br>
> > I just pulled the latest version of PETSc on master, and while my<br>
> > optimized build works fine, my debug build fails with the message<br>
> ><br>
> > make[1]: *** No rule to make target 'src/sys/logging/examples/makefile'.<br>
> > Stop.<br>
> > make: *** [GNUmakefile:17: src/sys/logging/examples/makefile] Error 2<br>
> ><br>
> > Doing<br>
> > ls src/sys/logging/examples<br>
> ><br>
> <br>
> Remove this directory. It is not in the repository, and its presence is<br>
> confusing the automatic detection for the build.<br>
> <br>
>   Thanks,<br>
> <br>
>      Matt<br>
> <br>
> <br>
> > shows a file named `index.html` and a directory named `tutorials`, but no<br>
> > makefile. My configure line is<br>
> ><br>
> > ./configure PETSC_ARCH=arch-linux-c-debug --with-cc=clang<br>
> > --with-cxx=clang++ COPTFLAGS="-O3 -march=native -mtune=native -fPIC"<br>
> > CXXOPTFLAGS="-O3 -march=native -mtune=native -fPIC" FOPTFLAGS="-O3<br>
> > -march=native -mtune=native -fPIC" --with-avx2=1 --download-mpich<br>
> > --download-hypre --download-scalapack --download-mumps --with-debugging=yes<br>
> > --with-blaslapack-dir=/opt/intel/mkl --download-zlib --download-libpng<br>
> > --download-giflib --download-libjpeg --download-slepc --download-eigen<br>
> ><br>
> > To reiterate, doing the exact same configure, but changing<br>
> > '-with-debugging=yes' to '-with-debugging=no' (and changing the PETSC_ARCH<br>
> > name to 'arch-linux-c-debug') and then building the non-debugging version<br>
> > of PETSc works as normal. Any ideas what could be going on?<br>
> ><br>
> > Thanks!<br>
> ><br>
> > -Zane Jakobs<br>
> ><br>
> <br>
> <br>
> <br>
<br>
</blockquote></div>