<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Tue, Sep 15, 2020 at 6:18 PM Jeremy Theler <<a href="mailto:jeremy@seamplex.com">jeremy@seamplex.com</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">On Mon, 2020-09-14 at 20:28 -0400, Matthew Knepley wrote:<br>
> On Mon, Sep 14, 2020 at 6:15 PM Jeremy Theler <<a href="mailto:jeremy@seamplex.com" target="_blank">jeremy@seamplex.com</a>><br>
> wrote:<br>
> > Hello all<br>
> > <br>
> > Say I have a fully-interpolated 3D DMPlex and a point with<br>
> > arbitrary<br>
> > coordinates x,y,z. What's the most efficient way to know which cell<br>
> > this point belongs to in parallel? Cells can be either tets or<br>
> > hexes.<br>
> <br>
> I should make a tutorial on this, but have not had time so far.<br>
<br>
Thank you very much for this mini-tutorial.<br>
<br>
> <br>
> The intention is that you use<br>
> <br>
>   <br>
> <a href="https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/DM/DMLocatePoints.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/DM/DMLocatePoints.html</a><br>
> <br>
> This will just brute force search unless you also give<br>
> <br>
>   -dm_plex_hash_location<br>
<br>
Well, for a 3D DMplex PETSc (and git blame) tells me that you "have<br>
only coded this for 2D." :-)<br></blockquote><div><br></div><div>Crap. I need to do 3D. It's not hard, just work.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
> which builds a grid hash to accelerate it. I should probably expose<br>
> <br>
>   DMPlexLocatePoint_Internal()<br>
> <br>
> which handles the single cell queries. If you just had one point,<br>
> that might make it simpler,<br>
> although you would still write your own loop.<br>
<br>
I see that DMLocatePoints() loops over all the cells until it finds the<br>
right one. I was thinking about finding first the nearest vertex to the<br>
point and then sweeping over all the cells that share this vertex<br>
testing for DMPlexLocatePoint_Internal(). The nearest node ought to be<br>
found using an octree or similar. Any direction regarding this idea?<br></blockquote><div><br></div><div>So you can imagine both a topological search and a geometric search. Generally, people want geometric.</div><div>The geometric hash we use is just to bin elements on a regular grid.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
>  If your intention is to interpolate a field at these<br>
> locations, I created<br>
> <br>
>   <br>
> <a href="https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/SNES/DMInterpolationCreate.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/SNES/DMInterpolationCreate.html</a><br>
> <br>
> which no one but me uses so far, but I think it is convenient.<br>
<br>
Any other example apart from src/snes/tutorials/ex63.c?<br></blockquote><div><br></div><div>That is the only one in PETSc. The PyLith code uses this to interpolate to seismic stations.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Thank you.<br>
<br>
> <br>
>   Thanks,<br>
> <br>
>     Matt<br>
>  <br>
> > Regards<br>
> > --<br>
> > jeremy theler<br>
> > <a href="http://www.seamplex.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.seamplex.com</a><br>
> > <br>
> > <br>
> <br>
> <br>
> <br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>