<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Thu, Jul 9, 2020 at 3:28 PM David Scott <<a href="mailto:d.scott@epcc.ed.ac.uk">d.scott@epcc.ed.ac.uk</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">

  
  <div>
    Matt,<br>
    <br>
    I'll have a go at writing Xdmf files.<br>
    <br>
    Am I right in thinking that VTK files are written sequentially?<br></div></blockquote><div><br></div><div>Yes, it is a rightly despised format, suitable only for beggars and serial jobs :)</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>
    Thanks,<br>
    <br>
    David<br>
    <br>
    <div>On 09/07/2020 20:17, Matthew Knepley
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      
      <div dir="ltr">
        <div dir="ltr">On Thu, Jul 9, 2020 at 2:51 PM David Scott <<a href="mailto:d.scott@epcc.ed.ac.uk" target="_blank">d.scott@epcc.ed.ac.uk</a>>
          wrote:<br>
        </div>
        <div class="gmail_quote">
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hello,<br>
            <br>
            I have written out a Vec using the (Fortran) HDF5 routines
            provided by<br>
            PETSc.<br>
            I now want to import the data into ParaView 5.8.0 and
            display a contour.<br>
            I can read the data in using VisItPixieReader but the
            contour tool is<br>
            not available. Can I use the HDF5 files produced by PETSc
            13.3.3 with<br>
            ParaView and, if so, how?<br>
          </blockquote>
          <div><br>
          </div>
          <div>When you call VecView(), it just writes an array of real
            numbers to the HDF5 file. If Paraview can use an array</div>
          <div>of real numbers, then you are all set. I don't know how
            to make Paraview do that. What I do is to write an</div>
          <div>Xdmf file that points to the HDF5 file for the data and
            specifies the mesh using XML. Note  that you can have</div>
          <div>a DMDA or DMPlex write VTK files, which Paraview can read
            directly.</div>
          <div><br>
          </div>
          <div>  Thanks,</div>
          <div><br>
          </div>
          <div>     Matt</div>
          <div> </div>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
            David<br>
            <br>
            <br>
            <br>
            The University of Edinburgh is a charitable body, registered
            in Scotland, with registration number SC005336.<br>
          </blockquote>
        </div>
        <br clear="all">
        <div><br>
        </div>
        -- <br>
        <div dir="ltr">
          <div dir="ltr">
            <div>
              <div dir="ltr">
                <div>
                  <div dir="ltr">
                    <div>What most experimenters take for granted before
                      they begin their experiments is infinitely more
                      interesting than any results to which their
                      experiments lead.<br>
                      -- Norbert Wiener</div>
                    <div><br>
                    </div>
                    <div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
                    </div>
                  </div>
                </div>
              </div>
            </div>
          </div>
        </div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
  </div>

</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>