<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">"make all test" gives the attached summary. </div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Looks like only one problem failed.</div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">All the others passed.</div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Thanks.</div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Sincerely,</div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Huq</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Jun 4, 2020 at 12:27 PM Satish Balay <<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov">balay@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Should work <br>
<br>
If it fails -  send us corresponding configure.log<br>
<br>
Satish<br>
<br>
On Thu, 4 Jun 2020, Fazlul Huq wrote:<br>
<br>
> I think it's okay to have a separate version of hypre for PETSc.<br>
> So, what I understand is I have to do,<br>
> <br>
> ./configure --with-cc=gcc --with-cxx=g++ --with-fc=gfortran<br>
> --download-mpich --download-fblaslapack --download-hypre<br>
> make all test<br>
> <br>
> Is that all?<br>
> Am I missing something?<br>
> <br>
> Thank you.<br>
> Sincerely,<br>
> Huq<br>
> <br>
> <br>
> On Thu, Jun 4, 2020 at 11:04 AM Satish Balay <<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov" target="_blank">balay@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
> <br>
> > Its best to use --download-hypre with PETSc configure - it installs a<br>
> > compatible version of hypre.<br>
> ><br>
> > If you have a pre-installed hypre, you'l have to:<br>
> > - make sure its compatible version<br>
> > - its built with the same MPI, compilers etc as PETSc<br>
> > - you can use --with-hypre-dir option with PETSc configure<br>
> ><br>
> > Satish<br>
> ><br>
> > On Thu, 4 Jun 2020, Fazlul Huq wrote:<br>
> ><br>
> > > I have HYPRE installed in my machine.<br>
> > > Ithink, I need to compile PETSc with HYPRE.<br>
> > > I'm not clear about how to do that?<br>
> > ><br>
> > > Thank you.<br>
> > > Sincerely,<br>
> > > Huq<br>
> > ><br>
> > > On Thu, Jun 4, 2020 at 10:13 AM Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>><br>
> > wrote:<br>
> > ><br>
> > > > On Thu, Jun 4, 2020 at 10:28 AM Fazlul Huq <<a href="mailto:huq2090@gmail.com" target="_blank">huq2090@gmail.com</a>> wrote:<br>
> > > ><br>
> > > >> Thank you.<br>
> > > >> Working now.<br>
> > > >><br>
> > > >> I think to run the following command I need to configure PETSc with<br>
> > HYPRE.<br>
> > > >> mpiexec -np 1 ./poisson_m -n 100000 -pc_type hypre -pc_hypre_type<br>
> > > >> boomerang<br>
> > > >><br>
> > > >> If I am right, can you please guide me how to configure with HYPRE and<br>
> > > >> run the above command?<br>
> > > >><br>
> > > ><br>
> > > > --download-hypre<br>
> > > ><br>
> > > >   Thanks,<br>
> > > ><br>
> > > >      Matt<br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > >> Thank you.<br>
> > > >> Sincerely,<br>
> > > >> Huq<br>
> > > >><br>
> > > >> On Thu, Jun 4, 2020 at 8:34 AM Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>><br>
> > wrote:<br>
> > > >><br>
> > > >>><br>
> > > >>> On Thu, Jun 4, 2020 at 9:19 AM Dave May <<a href="mailto:dave.mayhem23@gmail.com" target="_blank">dave.mayhem23@gmail.com</a>><br>
> > wrote:<br>
> > > >>><br>
> > > >>>><br>
> > > >>>><br>
> > > >>>> On Thu, 4 Jun 2020 at 14:17, Dave May <<a href="mailto:dave.mayhem23@gmail.com" target="_blank">dave.mayhem23@gmail.com</a>><br>
> > wrote:<br>
> > > >>>><br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>>> On Thu, 4 Jun 2020 at 14:15, Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>><br>
> > > >>>>> wrote:<br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>>>> On Thu, Jun 4, 2020 at 9:12 AM Fazlul Huq <<a href="mailto:huq2090@gmail.com" target="_blank">huq2090@gmail.com</a>><br>
> > wrote:<br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>>> Somehow, make is not working.<br>
> > > >>>>>>> Please find the attachment herewith for the terminal readout.<br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>> Since you built with PETSC_ARCH=linux-gnu, you need that in your<br>
> > > >>>>>> environment.<br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>>> Or just do<br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>>> make ex5 PETSC_ARCH=linux-gnu<br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>><br>
> > > >>>> sorry I hit send without checking your png)<br>
> > > >>>> The command should be<br>
> > > >>>><br>
> > > >>>> make ex5 PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug<br>
> > > >>>><br>
> > > >>><br>
> > > >>> No, your first one was right.<br>
> > > >>><br>
> > > >>>    Matt<br>
> > > >>><br>
> > > >>><br>
> > > >>>><br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>>><br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>>   Thanks,<br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>>      Matt<br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>>> Thank you.<br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>>> Sincerely,<br>
> > > >>>>>>> Huq<br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>>> On Thu, Jun 4, 2020 at 7:57 AM Matthew Knepley <<br>
> > <a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>><br>
> > > >>>>>>> wrote:<br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>>>> On Thu, Jun 4, 2020 at 8:53 AM Fazlul Huq <<a href="mailto:huq2090@gmail.com" target="_blank">huq2090@gmail.com</a>><br>
> > > >>>>>>>> wrote:<br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>> Hello,<br>
> > > >>>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>> I have a very preliminary question!<br>
> > > >>>>>>>>> I think I have installed PETSc correctly cause I got following<br>
> > on<br>
> > > >>>>>>>>> the terminal:<br>
> > > >>>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>> Command:<br>
> > > >>>>>>>>> make PETSC_DIR=/home/huq2090/petsc-3.10.2 PETSC_ARCH=linux-gnu<br>
> > > >>>>>>>>> check<br>
> > > >>>>>>>>> Response:<br>
> > > >>>>>>>>> Running check examples to verify correct installation<br>
> > > >>>>>>>>> Using PETSC_DIR=/home/huq2090/petsc-3.10.2 and<br>
> > PETSC_ARCH=linux-gnu<br>
> > > >>>>>>>>> C/C++ example src/snes/tutorials/ex19 run successfully with 1<br>
> > MPI<br>
> > > >>>>>>>>> process<br>
> > > >>>>>>>>> C/C++ example src/snes/tutorials/ex19 run successfully with 2<br>
> > MPI<br>
> > > >>>>>>>>> processes<br>
> > > >>>>>>>>> Fortran example src/snes/tutorials/ex5f run successfully with 1<br>
> > > >>>>>>>>> MPI process<br>
> > > >>>>>>>>> Completed test examples<br>
> > > >>>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>> Now, I am trying to run an example from the list of provided<br>
> > > >>>>>>>>> examples.<br>
> > > >>>>>>>>> Can you please help me out, how to run an example problem from<br>
> > the<br>
> > > >>>>>>>>> list of examples?<br>
> > > >>>>>>>>> I mean, how to make executable and run the executable?<br>
> > > >>>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>> cd $PETSC_DIR<br>
> > > >>>>>>>> cd src/snes/tutorials<br>
> > > >>>>>>>> make ex5<br>
> > > >>>>>>>> ./ex5 -snes_monitor<br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>   Thanks,<br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>      Matt<br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>> Thank you.<br>
> > > >>>>>>>>> Sincerely,<br>
> > > >>>>>>>>> Huq<br>
> > > >>>>>>>>> --<br>
> > > >>>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>>> Fazlul Huq<br>
> > > >>>>>>>>> Graduate Research Assistant<br>
> > > >>>>>>>>> Department of Nuclear, Plasma & Radiological Engineering (NPRE)<br>
> > > >>>>>>>>> University of Illinois at Urbana-Champaign (UIUC)<br>
> > > >>>>>>>>> E-mail: <a href="mailto:huq2090@gmail.com" target="_blank">huq2090@gmail.com</a><br>
> > > >>>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>> --<br>
> > > >>>>>>>> What most experimenters take for granted before they begin their<br>
> > > >>>>>>>> experiments is infinitely more interesting than any results to<br>
> > which their<br>
> > > >>>>>>>> experiments lead.<br>
> > > >>>>>>>> -- Norbert Wiener<br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>>> <a href="https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
> > > >>>>>>>> <<a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a>><br>
> > > >>>>>>>><br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>>> --<br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>>> Fazlul Huq<br>
> > > >>>>>>> Graduate Research Assistant<br>
> > > >>>>>>> Department of Nuclear, Plasma & Radiological Engineering (NPRE)<br>
> > > >>>>>>> University of Illinois at Urbana-Champaign (UIUC)<br>
> > > >>>>>>> E-mail: <a href="mailto:huq2090@gmail.com" target="_blank">huq2090@gmail.com</a><br>
> > > >>>>>>><br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>> --<br>
> > > >>>>>> What most experimenters take for granted before they begin their<br>
> > > >>>>>> experiments is infinitely more interesting than any results to<br>
> > which their<br>
> > > >>>>>> experiments lead.<br>
> > > >>>>>> -- Norbert Wiener<br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>>> <a href="https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
> > > >>>>>> <<a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a>><br>
> > > >>>>>><br>
> > > >>>>><br>
> > > >>><br>
> > > >>> --<br>
> > > >>> What most experimenters take for granted before they begin their<br>
> > > >>> experiments is infinitely more interesting than any results to which<br>
> > their<br>
> > > >>> experiments lead.<br>
> > > >>> -- Norbert Wiener<br>
> > > >>><br>
> > > >>> <a href="https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
> > > >>> <<a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a>><br>
> > > >>><br>
> > > >><br>
> > > >><br>
> > > >> --<br>
> > > >><br>
> > > >> Fazlul Huq<br>
> > > >> Graduate Research Assistant<br>
> > > >> Department of Nuclear, Plasma & Radiological Engineering (NPRE)<br>
> > > >> University of Illinois at Urbana-Champaign (UIUC)<br>
> > > >> E-mail: <a href="mailto:huq2090@gmail.com" target="_blank">huq2090@gmail.com</a><br>
> > > >><br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > > --<br>
> > > > What most experimenters take for granted before they begin their<br>
> > > > experiments is infinitely more interesting than any results to which<br>
> > their<br>
> > > > experiments lead.<br>
> > > > -- Norbert Wiener<br>
> > > ><br>
> > > > <a href="https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
> > > > <<a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a>><br>
> > > ><br>
> > ><br>
> > ><br>
> > ><br>
> ><br>
> ><br>
> <br>
> <br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><br><div><font face="comic sans ms, sans-serif">Fazlul Huq</font></div><div><font face="comic sans ms, sans-serif">Graduate Research Assistant</font></div><div><font face="comic sans ms, sans-serif">Department of Nuclear, Plasma & Radiological Engineering (NPRE)</font></div><div><font face="comic sans ms, sans-serif">University of Illinois at Urbana-Champaign (UIUC)</font></div><div><font face="comic sans ms, sans-serif">E-mail: <a href="mailto:huq2090@gmail.com" target="_blank">huq2090@gmail.com</a></font></div></div></div></div></div></div></div>