<div dir="ltr">Now that I look at it, I see:<div><br></div><div>CFLAGS="-fstack-protector -fno-stack-check -Qunused-arguments -O2 -g -Xpreprocessor -fopenmp -I"$(brew --prefix libomp)/include" -L"$(brew --prefix libomp)/lib -lomp"" prefix="/Users/markadams/Codes/petsc/arch-macosx-gnu-O-omp" <br></div><div><br></div><div>Note the two ". That does not look right. I use </div><div><br></div><div>'COPTFLAGS=-O2 -g  -Xpreprocessor -fopenmp -I"$(brew --prefix libomp)/include" -L"$(brew --prefix libomp)/lib -lomp" ',<br> <br></div><div>I know how to do stuff like:</div><div><br></div><div>'--with-blaslapack-lib=-L' + os.environ['OLCF_NETLIB_LAPACK_ROOT'] + '/lib64 -lblas -llapack'<br></div><div><br></div><div>Is there like and os.exec that I could use like this for my FLAGS?</div><div><br></div><div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Apr 13, 2020 at 11:46 AM Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com">knepley@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr">On Mon, Apr 13, 2020 at 11:34 AM Mark Adams <<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank">mfadams@lbl.gov</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">I get this error configuring zlib, osx, with OpenMP.<div>Any ideas?</div><div></div></div></blockquote><div><br></div><div>This failed without output</div><div><br></div><div>Executing: cd /Users/markadams/Codes/petsc/arch-macosx-gnu-O-omp/externalpackages/zlib-1.2.11 && CC="/usr/local/Cellar/mpich/3.3.2/bin/mpicc" CFLAGS="-fstack-protector -fno-stack-check -Qunused-arguments -O2 -g -Xpreprocessor -fopenmp -I"$(brew --prefix libomp)/include" -L"$(brew --prefix libomp)/lib -lomp"" prefix="/Users/markadams/Codes/petsc/arch-macosx-gnu-O-omp" ./configure  && /usr/bin/make -j7 -l12.0 &&  /usr/bin/make install<br></div><div><br></div><div>So execute each step in turn and see what fails.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Thanks,</div><div>Mark</div></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div>