<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Mon, Mar 23, 2020 at 7:46 AM Elias Karabelas <<a href="mailto:karabelaselias@gmail.com">karabelaselias@gmail.com</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Users,<br>
<br>
I want to implement a FCT (flux corrected transport) scheme with PETSc. <br>
To this end I have amongst other things create a Matrix whose entries <br>
are given by<br>
<br>
L_ij = -max(0, A_ij, A_ji) for i neq j<br>
<br>
L_ii = Sum_{j=0,..n, j neq i} L_ij<br>
<br>
where Mat A is an (non-symmetric) Input Matrix created beforehand.<br>
<br>
I was wondering how to do this. My first search brought me to <br>
<a href="https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/src/mat/examples/tutorials/ex16.c.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/src/mat/examples/tutorials/ex16.c.html</a> <br>
<br>
<br>
but this just goes over the rows of one matrix to set new values and now <br>
I would need to run over the rows and columns of the matrix. My Idea was <br>
to just create a transpose of A and do the same but then the row-layout <br>
will be different and I can't use the same for loop for A and AT and <br>
thus also won't be able to calculate the max's above.<br>
<br>
Any help would be appreciated<br></blockquote><div><br></div><div>I think it would likely be much easier to write your algorithm directly on the mesh, rather than using matrices, since the locality information is explicit with the mesh, but has to be reconstructed with the matrix.</div><div><br></div><div>The problem here is that in parallel there would be no easy way to get the halo you need using a matrix. You</div><div>really want the ghosted space for assembly, and that is provided by the DM objects. Does this make sense?</div><div>Unless anybody in PETSc has a better idea.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Best regards<br>
<br>
Elias<br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>