<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <p>Dear Matt,</p>
    <p>I've just found this answer from 2014</p>
    <p><a
href="https://lists.mcs.anl.gov/pipermail/petsc-users/2014-August/022450.html">https://lists.mcs.anl.gov/pipermail/petsc-users/2014-August/022450.html</a></p>
    <p>wondering if this would theoretically work.</p>
    <p>And the thing with this FCT-Schemes is, that they're build on
      purely algebraic considerations (like AMG) so I don't want to
      break it back down to mesh information if possible at all.</p>
    <p>Best regards</p>
    <p>Elias<br>
    </p>
    <div class="moz-cite-prefix">On 23/03/2020 13:02, Matthew Knepley
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CAMYG4GkvNm8yqnMa3wN4KHPEnWcFV-pu9ut2+Ccy++KCaSzmQg@mail.gmail.com">
      <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
      <div dir="ltr">
        <div dir="ltr">On Mon, Mar 23, 2020 at 7:46 AM Elias Karabelas
          <<a href="mailto:karabelaselias@gmail.com"
            moz-do-not-send="true">karabelaselias@gmail.com</a>>
          wrote:<br>
        </div>
        <div class="gmail_quote">
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px
            0.8ex;border-left:1px solid
            rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Users,<br>
            <br>
            I want to implement a FCT (flux corrected transport) scheme
            with PETSc. <br>
            To this end I have amongst other things create a Matrix
            whose entries <br>
            are given by<br>
            <br>
            L_ij = -max(0, A_ij, A_ji) for i neq j<br>
            <br>
            L_ii = Sum_{j=0,..n, j neq i} L_ij<br>
            <br>
            where Mat A is an (non-symmetric) Input Matrix created
            beforehand.<br>
            <br>
            I was wondering how to do this. My first search brought me
            to <br>
            <a
href="https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/src/mat/examples/tutorials/ex16.c.html"
              rel="noreferrer" target="_blank" moz-do-not-send="true">https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/src/mat/examples/tutorials/ex16.c.html</a>
            <br>
            <br>
            <br>
            but this just goes over the rows of one matrix to set new
            values and now <br>
            I would need to run over the rows and columns of the matrix.
            My Idea was <br>
            to just create a transpose of A and do the same but then the
            row-layout <br>
            will be different and I can't use the same for loop for A
            and AT and <br>
            thus also won't be able to calculate the max's above.<br>
            <br>
            Any help would be appreciated<br>
          </blockquote>
          <div><br>
          </div>
          <div>I think it would likely be much easier to write your
            algorithm directly on the mesh, rather than using matrices,
            since the locality information is explicit with the mesh,
            but has to be reconstructed with the matrix.</div>
          <div><br>
          </div>
          <div>The problem here is that in parallel there would be no
            easy way to get the halo you need using a matrix. You</div>
          <div>really want the ghosted space for assembly, and that is
            provided by the DM objects. Does this make sense?</div>
          <div>Unless anybody in PETSc has a better idea.</div>
          <div><br>
          </div>
          <div>  Thanks,</div>
          <div><br>
          </div>
          <div>     Matt</div>
          <div> <br>
          </div>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px
            0.8ex;border-left:1px solid
            rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
            Best regards<br>
            <br>
            Elias<br>
            <br>
          </blockquote>
        </div>
        <br clear="all">
        <div><br>
        </div>
        -- <br>
        <div dir="ltr" class="gmail_signature">
          <div dir="ltr">
            <div>
              <div dir="ltr">
                <div>
                  <div dir="ltr">
                    <div>What most experimenters take for granted before
                      they begin their experiments is infinitely more
                      interesting than any results to which their
                      experiments lead.<br>
                      -- Norbert Wiener</div>
                    <div><br>
                    </div>
                    <div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/"
                        target="_blank" moz-do-not-send="true">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br>
                    </div>
                  </div>
                </div>
              </div>
            </div>
          </div>
        </div>
      </div>
    </blockquote>
  </body>
</html>