<div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi Matt,<div><br></div><div></div><div><br></div><div><a href="https://arxiv.org/pdf/1907.02604.pdf">https://arxiv.org/pdf/1907.02604.pdf</a>  <br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Nov 25, 2019 at 7:54 PM Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com">knepley@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr">On Mon, Nov 25, 2019 at 6:25 PM Swarnava Ghosh <<a href="mailto:swarnava89@gmail.com" target="_blank">swarnava89@gmail.com</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear PETSc users and developers,<div><br></div><div>I am working with dmplex to distribute a 3D unstructured mesh made of tetrahedrons in a cuboidal domain. I had a few queries:</div><div>1) Is there any way of ensuring load balancing based on the number of vertices per MPI process.</div></div></blockquote><div><br></div><div>You can now call DMPlexRebalanceSharedPoints() to try and get better balance of vertices.</div><div> </div></div></div></blockquote><div>  Thank you for pointing out this function!  <br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>2) As the global domain is cuboidal, is the resulting domain decomposition also cuboidal on every MPI process? If not, is there a way to ensure this? For example in DMDA, the default domain decomposition for a cuboidal domain is cuboidal. </div></div></blockquote><div><br></div><div>It sounds like you do not want something that is actually unstructured. Rather, it seems like you want to</div><div>take a DMDA type thing and split it into tets. You can get a cuboidal decomposition of a hex mesh easily.</div><div>Call DMPlexCreateBoxMesh() with one cell for every process, distribute, and then uniformly refine. This</div><div>will not quite work for tets since the mesh partitioner will tend to violate that constraint. You could:</div><div><br></div></div></div></blockquote><div>No, I have an unstructured mesh that increases in resolution away from the center of the cuboid. See Figure: 5 in the ArXiv paper <a href="https://arxiv.org/pdf/1907.02604.pdf">https://arxiv.org/pdf/1907.02604.pdf</a>  for a slice through the midplane of the cuboid.  Given this type of mesh, will dmplex do a cuboidal domain decomposition?</div><div><br></div><div>Sincerely,</div><div>SG</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div></div><div>  a) Prescribe the distribution yourself using the Shell partitioner type</div><div><br></div><div>or</div><div><br></div><div>  b) Write a refiner that turns hexes into tets</div><div><br></div><div>We already have a refiner that turns tets into hexes, but we never wrote the other direction because it was not clear</div><div>that it was useful.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Sincerely,</div><div>SG</div></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div></div>