<div dir="ltr"><div dir="ltr">On Fri, Sep 20, 2019 at 7:54 AM Bao Kai via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
I understand that PETSc is not designed to be used this way, while I<br>
am wondering if someone have done something similar to this.<br>
<br>
We have the full matrix from a simulation and rhs vector. We would<br>
like to read in through PETSc in one process, then we use some<br>
partition functions to partition the matrix.<br>
<br>
Based on the partition information, we redistribute the matrix among<br>
the processes. Then we solve it in parallel.  It is for testing the<br>
performance of some parallel linear solver and preconditions.<br>
<br>
We are not in the position to develop a full parallel implementation<br>
of the simulator yet.<br></blockquote><div><br></div><div>This is not hard to do.</div><div><br></div><div>1) Write a simple serial converter that reads in your matrix in whatever format you have it, and output it in PETSc Binary format</div><div>     using MatView() with a binary viewer. Same for the vector, and they can be in the same file.</div><div><br></div><div>2) Run your parallel code and use MatLoad/VecLoad for the system and it will automatically partition it.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Thanks.<br>
<br>
Cheers,<br>
Kai Bao<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>