<div dir="ltr"><div dir="ltr"><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Jul 9, 2019 at 12:43 PM 我 via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div style="line-height:1.7;color:rgb(0,0,0);font-size:14px;font-family:Arial"><div>Hello all,</div><div>I set PCGAMG and KSPGRMES to solve the matrix which is formed by a particle method such as SPH. But when there is always a PETSC ERROR: </div><div>[2]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>[2]PETSC ERROR: Petsc has generated inconsistent data<br>[2]PETSC ERROR: Have un-symmetric graph (apparently). Use '-(null)pc_gamg_sym_graph true' to symetrize the graph or '-(null)pc_gamg_threshold -1' if the matrix is structurally symmetric.<br></div></div></blockquote><div><br></div><div>You need to add this. This will symmetrize the graph. I would guess that hypre does this by default.  You can just add this to your .petscrc file to essentially make it the default.</div><div><br></div><div><br></div></div></div>