<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">Sajid,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
I have also rested the simpler problem you provided. The branch hongzh/fix-computejacobian gives exactly the same numerical results as the master branch does, but runs much faster. So the solver seems to work correctly.
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">To rule out the possible compiler issues, you might want to try a different compiler or different optimization flags. Also you might want to try smaller stepsizes.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Hong
<div class=""><br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On May 20, 2019, at 4:47 PM, Sajid Ali <<a href="mailto:sajidsyed2021@u.northwestern.edu" class="">sajidsyed2021@u.northwestern.edu</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div class="">Hi Hong, <br class="">
<br class="">
</div>
I tried running a simpler problem that solves the equation ` <span class="gmail-pl-c">
u_t = A*u_xx + A*u_yy; </span>` and the fix-computejacobian branch works for this on a coarse grid. The code for the same is here :
<a href="https://github.com/s-sajid-ali/xwp_petsc/blob/master/2d/FD/free_space/ex_dmda.c" class="">
https://github.com/s-sajid-ali/xwp_petsc/blob/master/2d/FD/free_space/ex_dmda.c</a> and it requires no input file. It writes at all times steps and comparing the output at the last time step, everything looks fine.
<br class="">
<br class="">
</div>
I want to eliminate a possible source of error which could be the fact that I installed both versions (3.11.2 and fix-computejacobian) with intel compilers and O3. Could floating point errors occur due to this ? I didn't specify -fp-model strict but since the
 results I got were reasonable I never bothered to run a test suite. <br class="">
</div>
<br class="">
</div>
Thank You, <br class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="gmail-m_3922982306795235160gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">
<div style="font-size:12.8px" class="">Sajid Ali<br class="">
</div>
<div style="font-size:12.8px" class="">Applied Physics<br class="">
</div>
<div style="font-size:12.8px" class="">Northwestern University</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</body>
</html>