<div dir="ltr">This looks like an error in MUMPS:<br><div><br></div><div><pre style="color:rgb(0,0,0);white-space:pre-wrap">        IF ( IROW_GRID .NE. root%MYROW .OR.
     &       JCOL_GRID .NE. root%MYCOL ) THEN
            WRITE(*,*) MYID,':INTERNAL Error: recvd root arrowhead '</pre></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Apr 8, 2019 at 1:37 PM Smith, Barry F. via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">  Difficult to tell what is going on. <br>
<br>
  The message User provided function() line 0 in  unknown file  indicates the crash took place OUTSIDE of PETSc code and error message INTERNAL Error: recvd root arrowhead  is definitely not coming from PETSc. <br>
<br>
   Yes, debug with the debug version and also try valgrind.<br>
<br>
   Barry<br>
<br>
<br>
> On Apr 8, 2019, at 12:12 PM, Manav Bhatia via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
> <br>
> <br>
> Hi,<br>
>   <br>
>     I am running a code a nonlinear simulation using mesh-refinement on libMesh. The code runs without issues on a Mac (can run for days without issues), but crashes on Linux (Centos 6). I am using version 3.11 on Linux with openmpi 3.1.3 and gcc8.2. <br>
> <br>
>     I tried to use the -on_error_attach_debugger, but it only gave me this message. Does this message imply something to the more experienced eyes? <br>
> <br>
>     I am going to try to build a debug version of petsc to figure out what is going wrong. I will get and share more detailed logs in a bit. <br>
> <br>
> Regards,<br>
> Manav<br>
> <br>
> [8]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
> [8]PETSC ERROR: Caught signal number 11 SEGV: Segmentation Violation, probably memory access out of range<br>
> [8]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
> [8]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
> [8]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
> [8]PETSC ERROR: configure using --with-debugging=yes, recompile, link, and run <br>
> [8]PETSC ERROR: to get more information on the crash.<br>
> [8]PETSC ERROR: User provided function() line 0 in  unknown file  <br>
> PETSC: Attaching gdb to /cavs/projects/brg_codes/users/bhatia/mast/mast_topology/opt/examples/structural/example_5/structural_example_5 of pid 2108 on display localhost:10.0 on machine <a href="http://Warhawk1.HPC.MsState.Edu" rel="noreferrer" target="_blank">Warhawk1.HPC.MsState.Edu</a><br>
> PETSC: Attaching gdb to /cavs/projects/brg_codes/users/bhatia/mast/mast_topology/opt/examples/structural/example_5/structural_example_5 of pid 2112 on display localhost:10.0 on machine <a href="http://Warhawk1.HPC.MsState.Edu" rel="noreferrer" target="_blank">Warhawk1.HPC.MsState.Edu</a><br>
>            0 :INTERNAL Error: recvd root arrowhead <br>
>            0 :not belonging to me. IARR,JARR=       67525       67525<br>
>            0 :IROW_GRID,JCOL_GRID=           0           4<br>
>            0 :MYROW, MYCOL=           0           0<br>
>            0 :IPOSROOT,JPOSROOT=    92264688    92264688<br>
> --------------------------------------------------------------------------<br>
> MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD<br>
> with errorcode -99.<br>
> <br>
> NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.<br>
> You may or may not see output from other processes, depending on<br>
> exactly when Open MPI kills them.<br>
> --------------------------------------------------------------------------<br>
> <br>
<br>
</blockquote></div>