<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">On Fri, Mar 1, 2019 at 10:53 AM Myriam Peyrounette via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
I used to run my code with PETSc 3.6. Since I upgraded the PETSc version<br>
to 3.10, this code has a bad memory scaling.<br>
<br>
To report this issue, I took the PETSc script ex42.c and slightly<br>
modified it so that the KSP and PC configurations are the same as in my<br>
code. In particular, I use a "personnalised" multi-grid method. The<br>
modifications are indicated by the keyword "TopBridge" in the attached<br>
scripts.<br>
<br>
To plot the memory (weak) scaling, I ran four calculations for each<br>
script with increasing problem sizes and computations cores:<br>
<br>
1. 100,000 elts on 4 cores<br>
2. 1 million elts on 40 cores<br>
3. 10 millions elts on 400 cores<br>
4. 100 millions elts on 4,000 cores<br>
<br>
The resulting graph is also attached. The scaling using PETSc 3.10<br>
clearly deteriorates for large cases, while the one using PETSc 3.6 is<br>
robust.<br>
<br>
After a few tests, I found that the scaling is mostly sensitive to the<br>
use of the AMG method for the coarse grid (line 1780 in<br>
main_ex42_petsc36.cc). In particular, the performance strongly<br>
deteriorates when commenting lines 1777 to 1790 (in main_ex42_petsc36.cc).<br>
<br>
Do you have any idea of what changed between version 3.6 and version<br>
3.10 that may imply such degradation?<br></blockquote><div><br></div><div>I believe the default values for PCGAMG changed between versions. It sounds like the coarsening rate</div><div>is not great enough, so that these grids are too large. This can be set using:</div><div><br></div><div>  <a href="https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/PC/PCGAMGSetThreshold.html">https://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/PC/PCGAMGSetThreshold.html</a></div><div><br></div><div>There is some explanation of this effect on that page. Let us know if setting this does not correct the situation.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Let me know if you need further information.<br>
<br>
Best,<br>
<br>
Myriam Peyrounette<br>
<br>
<br>
-- <br>
Myriam Peyrounette<br>
CNRS/IDRIS - HLST<br>
--<br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div>