<div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, Jan 16, 2019 at 1:12 PM Yann Jobic via petsc-users <<a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov">petsc-users@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi, sorry if this is an obvious question, but i don't know how to use <br>
the ghost nodes with a DMPlex.<br></blockquote><div><br></div><div>DMGlobalToLocal() and DMLocalToGlobal().</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
The procedure i do is as follow :<br>
<br>
1) create the DMPlex<br>
<br>
2) distribute it<br>
<br>
3) Create the Matrix and associated vectors with DMCreateMatrix, <br>
DMCreateGlobalVector and DMCreateLocalVector<br>
<br>
4) In each cells, compute the different integrals (FEM code)<br></blockquote><div><br></div><div>Yes</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
I know the location of the ghost points, as the global index is negative <br>
(and the global index is -(i+1) using the global PetscSection).<br></blockquote><div><br></div><div>Yes</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
(I didn't use DMPlexConstructGhostCells, as i understood that is should <br>
be used for flux calculations on faces for FV methods).<br></blockquote><div><br></div><div>Yes</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
I would like to update the contributions of those ghost nodes, where the <br>
vertex actually is (in a different processor).<br></blockquote><div><br></div><div>Yes, use LocalToGlobal()</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
So far, i used VecSetValues with the local indexes of the local vector. <br>
Then i used DMLocalToGlobalBegin in order to update them. It's working fine.<br></blockquote><div><br></div><div>Okay, that is the way to do it.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
I tried  MatSetValues on the global Matrix with the global indexes. It <br>
seems to work.<br></blockquote><div><br></div><div>Yes</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
However, maybe i'm doing it the wrong way, with a lot of communications. <br>
Is it a scalable way the handle them ? How should i do it ?<br></blockquote><div><br></div><div>What you described is scalable. There is only 1 communication.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
If i can have a starting point, it would be great !<br>
<br>
Any help would be greatly appreciated!<br>
<br>
Regards,<br>
<br>
Yann<br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.cse.buffalo.edu/~knepley/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div></div></div></div>