<div dir="ltr">The default git gives me:<div><br></div><div><i>Could not execute "['git', 'rev-parse', '--git-dir']"</i></div><div><i><br></i></div><div>when I am configuring PETSc. </div><div><br></div><div>The manually loaded <i>gits</i>  work just fine.</div><div><br></div><div><br></div><div>Fande,<br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 4, 2018 at 5:04 PM, Garvey, Cormac T <span dir="ltr"><<a href="mailto:cormac.garvey@inl.gov" target="_blank">cormac.garvey@inl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div>I though it was fixed, yes I will look into it again.<br><br></div>Do you get an error just doing a git clone on falcon1 and falcon2?<br></div></div></div><div class="gmail-HOEnZb"><div class="gmail-h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 4, 2018 at 4:48 PM, Kong, Fande <span dir="ltr"><<a href="mailto:fande.kong@inl.gov" target="_blank">fande.kong@inl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>module load git/2.16.2-GCCcore-5.4.0"  also works. <br><br></div>Could you somehow make the default git work as well? Hence we do not need to have this extra "module load for git"<span class="gmail-m_2884162184443939533HOEnZb"><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span class="gmail-m_2884162184443939533HOEnZb"><font color="#888888">Fande,<br></font></span></div><div class="gmail-m_2884162184443939533HOEnZb"><div class="gmail-m_2884162184443939533h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 4, 2018 at 4:43 PM, Kong, Fande <span dir="ltr"><<a href="mailto:fande.kong@inl.gov" target="_blank">fande.kong@inl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Thanks, Cormac,<br><br></div><i>module load git/1.8.5.2-GCC-4.8.3 </i><br><br></div>works for me.<br><br></div>Did not try "module load git/2.16.2-GCCcore-5.4.0" yet.<br><br></div>I will try, and get it back here.<span class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229HOEnZb"><font color="#888888"><br><br><br><br></font></span></div><span class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229HOEnZb"><font color="#888888">Fande<br></font></span></div><div class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229HOEnZb"><div class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 4, 2018 at 4:39 PM, Garvey, Cormac T <span dir="ltr"><<a href="mailto:cormac.garvey@inl.gov" target="_blank">cormac.garvey@inl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div><div><br></div>We needed to rebuilt git on the INL falcon cluster because github server changed such that it no longer accepted TLSv1.<br><br></div>The default git on the falcon cluster /usr/bin/git is just a wrapper script, so users would not need to load any modules to<br></div>use git.<br><br></div>When you load load git on falcon1 or falcon2 does it still fail?<br><br></div>module load git/2.16.2-GCCcore-5.4.0<br><br></div>Thanks,<br></div>Cormac.<br><div><div><div><div><br><br></div></div></div></div></div><div class="gmail_extra"><div><div class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229m_-7521737409199396484h5"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 4, 2018 at 4:28 PM, Kong, Fande <span dir="ltr"><<a href="mailto:fande.kong@inl.gov" target="_blank">fande.kong@inl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>Hi Cormac,<br><br></div>Do you know anything on "git"? How did you guys build git on the falcon1?  The default git on Falcon1 does not work with petsc any more. <br><br><br></div>Fande,<br><div><div><div><div><div class="gmail_extra"><br><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 4, 2018 at 4:20 PM, Satish Balay <span dir="ltr"><<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov" target="_blank">balay@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Ok - I don't think I have access to this OS.<br>
<br>
And I see its from 2009 [sure its enterprise os - with regular backport updates]<br>
<br>
But its wierd that you have such a new version of git at /usr/bin/git<br>
<br>
>From what we know so far - the problem appears to be some bad<br>
interaction of python-2.6 with this old OS [i.e old glibc etc..] - and<br>
this new git version [binary built locally or on a different OS and installed locally ?].<br>
<span class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229m_-7521737409199396484m_1386961065578743813m_6449600553352604355HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Satish<br>
</font></span><div class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229m_-7521737409199396484m_1386961065578743813m_6449600553352604355HOEnZb"><div class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229m_-7521737409199396484m_1386961065578743813m_6449600553352604355h5"><br>
On Wed, 4 Apr 2018, Kong, Fande wrote:<br>
<br>
>  moose]$ uname -a<br>
> Linux falcon1 3.0.101-108.13-default #1 SMP Wed Oct 11 12:30:40 UTC 2017<br>
> (294ccfe) x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux<br>
><br>
><br>
> moose]$ lsb_release -a<br>
> LSB Version:<br>
> core-2.0-noarch:core-3.2-noarc<wbr>h:core-4.0-noarch:core-2.0-x86<wbr>_64:core-3.2-x86_64:core-4.0-x<wbr>86_64:desktop-4.0-amd64:deskto<wbr>p-4.0-noarch:graphics-2.0-amd6<wbr>4:graphics-2.0-noarch:graphics<wbr>-3.2-amd64:graphics-3.2-noarch<wbr>:graphics-4.0-amd64:graphics-4<wbr>.0-noarch<br>
> Distributor ID:    SUSE LINUX<br>
> Description:    SUSE Linux Enterprise Server 11 (x86_64)<br>
> Release:    11<br>
> Codename:    n/a<br>
><br>
><br>
><br>
> On Wed, Apr 4, 2018 at 4:08 PM, Satish Balay <<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov" target="_blank">balay@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
><br>
> > On Wed, 4 Apr 2018, Satish Balay wrote:<br>
> ><br>
> > > On Wed, 4 Apr 2018, Satish Balay wrote:<br>
> > ><br>
> > > > was your '2.16.2' version installed from source?<br>
> > ><br>
> > > >>><br>
> > > Checking for program /usr/bin/git...found<br>
> > >                 Defined make macro "GIT" to "git"<br>
> > > Executing: git --version<br>
> > > stdout: git version 2.16.2<br>
> > > <<<<<br>
> > ><br>
> > > I gues its the OS default package<br>
> > ><br>
> > > >>>>><br>
> > > Machine platform:<br>
> > > ('Linux', 'falcon1', '3.0.101-108.13-default', '#1 SMP Wed Oct 11<br>
> > 12:30:40 UTC 2017 (294ccfe)', 'x86_64', 'x86_64')<br>
> > > Python version:<br>
> > > 2.6.9 (unknown, Aug  5 2016, 11:15:31)<br>
> > > [GCC 4.3.4 [gcc-4_3-branch revision 152973]]<br>
> > > <<<<<br>
> > ><br>
> > > What OS/version is on this machine? I can try reproducing in a VM<br>
> ><br>
> > It is strange that the kernel is old [3.0 - perhaps LTS OS] , python is<br>
> > old [2.6] - but git is new? [2.16?]<br>
> ><br>
> > <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__" rel="noreferrer" target="_blank">https://urldefense.proofpoint.<wbr>com/v2/url?u=https-3A__</a><br>
> > mirrors.edge.kernel.org_pub_so<wbr>ftware_scm_git_&d=DwIBAg&c=<br>
> > 54IZrppPQZKX9mLzcGdPfFD1hxrcB_<wbr>_aEkJFOKJFd00&r=DUUt3SRGI0_<br>
> > JgtNaS3udV68GRkgV4ts7XKfj2opmi<wbr>CY&m=WF6ZxIh9Z9Hh2kYY0w70aNrgf<wbr>Picp6<br>
> > kgIh5BvezPiEY&s=KWMsO7XC0-pQuQ<wbr>_mD03tNJWEpxSTATlZW_DmX0QofGw&<wbr>e=<br>
> > git-2.16.2.tar.gz                                  16-Feb-2018 17:48<br>
> > 7M<br>
> ><br>
> > Satish<br>
> ><br>
><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br></div></div><span class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229m_-7521737409199396484HOEnZb"><font color="#888888">-- <br><div class="gmail-m_2884162184443939533m_8894973890118705229m_-7521737409199396484m_1386961065578743813gmail_signature">Cormac Garvey<br>HPC Software Consultant<br>Scientific Computing<br>Idaho National Laboratory<br>Ph: 208-526-6294<br><br></div>
</font></span></div>
</blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail-m_2884162184443939533gmail_signature">Cormac Garvey<br>HPC Software Consultant<br>Scientific Computing<br>Idaho National Laboratory<br>Ph: 208-526-6294<br><br></div>
</div>
</div></div></blockquote></div><br></div></div></div>