<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Mon, Apr 2, 2018 at 10:52 PM, Sepideh Kavousi <span dir="ltr"><<a href="mailto:skavou1@lsu.edu" target="_blank">skavou1@lsu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div id="m_-290898563111525184divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">Hi all,</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">I wrote a petsc code, and I defined my variables in a separate file, namely common.h, and common.c as following</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">common.h:</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"></p>
<div>
<blockquote>extern int i;<br>
extern int n;</blockquote></div></div></div></blockquote><div>Notice that these declarations are inconsistent for the main file.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div id="m_-290898563111525184divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0">common.c:<br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"></p>
<div>
<blockquote>#include <petsc.h><br>
#include "common.h<br>
PetscScalar i;      // Define i and initialize<br>
PetscScalar n;      // Define n and initialize<br>
i=2.2;<br>
n=3.5;</blockquote>
</div>
Now in my prog.c  code I have:
<p></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"></p>
<div>
<blockquote>#include <petsc.h><br>
#include <common.h><br>
static char help[]="program main";<br>
int main (int argc, char **argv){<br>
PetscInitialize(&argc,&argv, (char*) 0,help);<br>
PetscPrintf(PETSC_COMM_WORLD,"<wbr>i=%f!\n",a);<br>
PetscPrintf(PETSC_COMM_WORLD,"<wbr>n=%f!\n",b) ;<br>
PetscFinalize();<br>
}<br>
<br>
</blockquote>
if my it was not using petsc and it was a normal c code, I could run it using the following command:</div>
<div>          gcc prog. c common.c</div>
<div>but now that I am using petsc, I do not know how should I include common.c in my makefile.</div>
<div>my makefile looks like this:</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<blockquote>include ${PETSC_DIR}/lib/petsc/conf/<wbr>variables<br>
include ${PETSC_DIR}/lib/petsc/conf/<wbr>rules<br>
prog: prog.o  chkopts<br>
<blockquote>-${CLINKER} -o prog.out prog.o ${PETSC_LIB} <br>
</blockquote>
<blockquote>${RM} *.o<br>
</blockquote>
</blockquote>
</div>
<div>
<blockquote></blockquote></div></div></div></div></blockquote><div>You want</div><div><br></div><div>prog: prog.o common.o chkopts</div><div>      -${CLINKER} -o prog.out prog.o common.o ${PETSC_LIB}</div><div><br></div><div>   Matt</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div id="m_-290898563111525184divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr"><div><div><blockquote>.PHONY: distclean rune_1 test<br>
distclean:<br>
<blockquote>@rm -f *~ prog<br>
</blockquote>
</blockquote>
Thanks,</div>
<div>Sepideh<br>
</div>
<br>
</div>
<div><br>
</div>
<br>
<p></p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
<p style="margin-top:0;margin-bottom:0"><br>
</p>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.caam.rice.edu/~mk51/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div>
</div></div>