<div dir="ltr">This is what I get:<div><br><div><div>hpca-login:~> mpicc -show</div><div>gcc -I/opt/sgi/mpt/mpt-2.12/include -L/opt/sgi/mpt/mpt-2.12/lib -lmpi -lpthread /usr/lib64/libcpuset.so.1 /usr/lib64/libbitmask.so.1</div></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Dec 20, 2017 at 11:59 PM, Satish Balay <span dir="ltr"><<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov" target="_blank">balay@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">>>><br>
Executing: mpicc -E  -I/dev/shm/pbs.3111462.hpc-<wbr>pbs/petsc-fdYfuH/config.<wbr>setCompilers  /dev/shm/pbs.3111462.hpc-pbs/<wbr>petsc-fdYfuH/config.<wbr>setCompilers/conftest.c<br>
stderr:<br>
gcc: warning: /usr/lib64/libcpuset.so.1: linker input file unused because linking not done<br>
gcc: warning: /usr/lib64/libbitmask.so.1: linker input file unused because linking not done<br>
<<<<<br>
<br>
Looks like your mpicc is printing this verbose thing on stdout [why is<br>
it doing a link check during preprocesing?] - thus confusing PETSc<br>
configure.<br>
<br>
Workarround is to fix this compiler not to print such messages. Or use different compilers..<br>
<br>
What do you have for:<br>
<br>
mpicc -show<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<br>
Satish<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Wed, 20 Dec 2017, Santiago Andres Triana wrote:<br>
<br>
> Dear petsc-users,<br>
><br>
> I'm trying to install petsc in a cluster using SGI's MPT. The mpicc<br>
> compiler is in the search path. The configure command is:<br>
><br>
> ./configure --with-scalar-type=complex --with-mumps=1 --download-mumps<br>
> --download-parmetis --download-metis --download-scalapack<br>
><br>
> However, this leads to an error (configure.log attached):<br>
><br>
> ==============================<wbr>==============================<wbr>===================<br>
>              Configuring PETSc to compile on your system<br>
><br>
> ==============================<wbr>==============================<wbr>===================<br>
> TESTING: checkCPreprocessor from<br>
> config.setCompilers(config/<wbr>BuildSystem/config/<wbr>setCompilers.py:599)<br>
><br>
> ******************************<wbr>******************************<wbr>*******************<br>
>          UNABLE to CONFIGURE with GIVEN OPTIONS    (see configure.log for<br>
> details):<br>
> ------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>-------------------<br>
> Cannot find a C preprocessor<br>
> ******************************<wbr>******************************<wbr>*******************<br>
><br>
> The configure.log says something about cpp32, here's the excerpt:<br>
><br>
> Possible ERROR while running preprocessor: exit code 256<br>
> stderr:<br>
> gcc: error: cpp32: No such file or directory<br>
><br>
><br>
> Any ideas of what is going wrong? any help or comments are highly<br>
> appreciated. Thanks in advance!<br>
><br>
> Andres<br>
><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>