<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Sun, Sep 10, 2017 at 2:39 AM, Praveen C <span dir="ltr"><<a href="mailto:cpraveen@gmail.com" target="_blank">cpraveen@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear all<div><br></div><div>I am solving 3 coupled first order PDE in 2-D with SNES. The stencil is (3+1+3) in both directions due to weno scheme. I want to use matrix-free gmres. For preconditioner, I will use first order scheme with stencil (1+1+1) in both directions. I am using DMDA.</div><div><br></div><div>Two things that I am looking for are:</div><div><br></div><div>How to setup the matrix ?</div><div><br></div><div>Since I have 3 variables at each grid point, how to fill the jacobian matrix.</div><div><br></div><div>Is there an existing example that comes close to this situation. My search was not fruitful.</div></div></blockquote><div><br></div><div>No. You want 2 DAs, 1 for evaluating residuals with s = 3, and one for making a Jacobian with s = 1. You give these</div><div>two DAs to</div><div><br></div><div><a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/SNES/DMDASNESSetFunctionLocal.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/SNES/DMDASNESSetFunctionLocal.html</a><br></div><div><a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/SNES/DMDASNESSetJacobianLocal.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/SNES/DMDASNESSetJacobianLocal.html</a><br></div><div><br></div><div>and I think it should work as you want. Its too bad we cannot handle this case with SNESSetDM() since it only takes</div><div>a single DM and there is no way to specialize the Jacobian.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Matt</div><div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Thank you</div><span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888"><div>praveen</div></font></span></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.caam.rice.edu/~mk51/" target="_blank">http://www.caam.rice.edu/~mk51/</a><br></div></div></div>
</div></div>