<div dir="ltr"><div><div><div>Hi Satish,<br><br></div>Thanks for the suggestions. I will change make makefiles and try to make it work. However, I would like to state that the above problem appears only while linking to petsc-3.7.5. My code compiles well with petsc-3.6.3. The configuration options were same for both petsc-3.7.5 and petsc-3.6.3. <br><br></div>Thanks again,<br></div>Bikash<br><div><div><br> <br></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Mar 21, 2017 at 7:11 PM, Satish Balay <span dir="ltr"><<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov" target="_blank">balay@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Should have said:<br>
<br>
make getccompiler getincludedirs getlinklibs<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Satish<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Tue, 21 Mar 2017, Satish Balay wrote:<br>
<br>
> Ok - Then the issue might be with your makefile.  Perhaps its not a<br>
> petsc formatted makefile.<br>
><br>
> In this case - run 'make getincludedirs getlibs' in PETSC_DIR - and<br>
> use the compilers, compile/link options listed there.<br>
><br>
> Satish<br>
><br>
> On Tue, 21 Mar 2017, Bikash Kanungo wrote:<br>
><br>
> > Hi Satish,<br>
> ><br>
> > Yes, I ran 'make test' and it didn't throw any error. Here's my test.log:<br>
> ><br>
> > Running test examples to verify correct installation<br>
> > Using<br>
> > PETSC_DIR=/home/bikashk/<wbr>softwares/femdft_softwares/<wbr>petsc/opt_3.7.5_mvapich2_<wbr>64bit_complex<br>
> > and PETSC_ARCH=<br>
> > C/C++ example src/snes/examples/tutorials/<wbr>ex19 run successfully with 1 MPI<br>
> > process<br>
> > C/C++ example src/snes/examples/tutorials/<wbr>ex19 run successfully with 2 MPI<br>
> > processes<br>
> > Fortran example src/snes/examples/tutorials/<wbr>ex5f run successfully with 1<br>
> > MPI process<br>
> > Completed test examples<br>
> ><br>
> ><br>
> > Thanks,<br>
> > Bikash<br>
> ><br>
> > On Tue, Mar 21, 2017 at 6:51 PM, Satish Balay <<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov">balay@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
> ><br>
> > > Did you run 'make test' after insatalling PETSc? Were there errors with<br>
> > > this test?<br>
> > ><br>
> > > [you can send us corresponding test.log]<br>
> > ><br>
> > > Satish<br>
> > ><br>
> > > On Tue, 21 Mar 2017, Bikash Kanungo wrote:<br>
> > ><br>
> > > > Hi,<br>
> > > ><br>
> > > > I have recently installed petsc-3.7.5. However, while linking petsc with<br>
> > > my<br>
> > > > code, I get the following compilation error:<br>
> > > ><br>
> > > > /home/bikashk/softwares/<wbr>femdft_softwares/petsc/opt_3.<br>
> > > 7.5_mvapich2_64bit_complex/<wbr>include/petscdraw.h(335):<br>
> > > > error: identifier "jmp_buf" is undefined<br>
> > > >   PETSC_EXTERN jmp_buf PetscXIOErrorHandlerJumpBuf;<br>
> > > ><br>
> > > ><br>
> > > > I used the following configure options while compiling petsc:<br>
> > > > ./configure<br>
> > > > --prefix=/home/bikashk/<wbr>softwares/femdft_softwares/<br>
> > > petsc/opt_3.7.5_mvapich2_<wbr>64bit_complex<br>
> > > > --with-debugging=no --with-scalar-type=complex CFLAGS="-O3 -xcore-avx2"<br>
> > > > CXXFLAGS="-O3 -xcore-avx2" --with-mpi-dir=/opt/mvapich2/<wbr>intel/ib/<br>
> > > > -with-blas-lib="-Wl,--start-<wbr>group<br>
> > > > /opt/intel/composer_xe_2015.2.<wbr>164/mkl/lib/intel64/libmkl_<wbr>intel_lp64.a<br>
> > > > /opt/intel/composer_xe_2015.2.<wbr>164/mkl/lib/intel64/libmkl_<wbr>sequential.a<br>
> > > > /opt/intel/composer_xe_2015.2.<wbr>164/mkl/lib/intel64/libmkl_<wbr>core.a<br>
> > > > -Wl,--end-group -lpthread -lm" --with-lapack-lib="-Wl,--<wbr>start-group<br>
> > > > /opt/intel/composer_xe_2015.2.<wbr>164/mkl/lib/intel64/libmkl_<wbr>intel_lp64.a<br>
> > > > /opt/intel/composer_xe_2015.2.<wbr>164/mkl/lib/intel64/libmkl_<wbr>sequential.a<br>
> > > > /opt/intel/composer_xe_2015.2.<wbr>164/mkl/lib/intel64/libmkl_<wbr>core.a<br>
> > > > -Wl,--end-group -lpthread -lm" --with-cxx-dialect=C++11<br>
> > > ><br>
> > > > I would really appreciate any help on how to fix it.<br>
> > > ><br>
> > > > Thanks,<br>
> > > > Bikash<br>
> > > ><br>
> > ><br>
> > ><br>
> ><br>
> ><br>
> ><br>
><br>
><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div><div><div><font color="#666666">Bikash S. Kanungo<br></font></div><font color="#666666">PhD Student<br></font></div><font color="#666666">Computational Materials Physics Group<br></font></div><font color="#666666">Mechanical Engineering <br></font></div><font color="#666666">University of Michigan<br><br></font></div></div>
</div>