<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 5, 2017 at 6:31 AM, Patrick Begou <span dir="ltr"><<a href="mailto:Patrick.Begou@legi.grenoble-inp.fr" target="_blank">Patrick.Begou@legi.grenoble-inp.fr</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I am unable to run any test on petsc. It looks like if the ex19 run freeze on the server as it do not use any cpu time and pstree shows<br>
<br>
sshd---bash-+-gedit<br>
            `-make---sh-+-gmake---sh---gma<wbr>ke---sh---mpiexec---ex19<br>
                        `-tee<br>
I've tested petsc-3.7.5.tar.gz and  the latest sources on the Git repository.<br></blockquote><div><br></div><div>All make is doing is running ex19, which you can do by hand. What do you get for</div><div><br></div><div>  cd $PETSC_DIR</div><div>  cd src/snes/examples/tutorials</div><div>  make ex19</div><div>  mpiexec -n 2 ./ex19 -snes_monitor</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Setup from the Git repo:<br>
./configure --prefix=/kareline/data/begou/<wbr>YALES2_1.0.0/PREREQUIS/petsc-g<wbr>it-binaries \<br>
--PETSC_ARCH=GCC48 \<br>
--PETSC_DIR=/kareline/data/beg<wbr>ou/YALES2_1.0.0/PREREQUIS/pets<wbr>c-git \<br>
--with-shared-libraries=0 \<br>
--with-fortran-interfaces=1 \<br>
--with-fortran-kernels=1 \<br>
--with-cc=mpicc \<br>
--with-fc=mpif90 \<br>
--with-cxx=mpicxx<br>
<br>
 make PETSC_DIR=/kareline/data/begou<wbr>/YALES2_1.0.0/PREREQUIS/petsc-<wbr>git PETSC_ARCH=GCC48 all<br>
<br>
 make PETSC_DIR=/kareline/data/begou<wbr>/YALES2_1.0.0/PREREQUIS/petsc-<wbr>git PETSC_ARCH=GCC48 install<br>
<br>
 make PETSC_DIR=/kareline/data/begou<wbr>/YALES2_1.0.0/PREREQUIS/petsc-<wbr>git-binaries PETSC_ARCH="" test<br>
<br>
<br>
In the log file I've just:<br>
<br>
Running test examples to verify correct installation<br>
Using PETSC_DIR=/kareline/data/begou<wbr>/YALES2_1.0.0/PREREQUIS/petsc-<wbr>git-binaries and PETSC_ARCH=<br>
<br>
I'm using:<br>
gcc version 4.8.1<br>
Open MPI: 1.7.3 (build with gcc 4.8.1)<br>
(This environment is in production for a while for many local software and works fine)<br>
<br>
Any suggestion is welcome<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<br>
Patrick<br>
<br>
-- <br>
==============================<wbr>==============================<wbr>=======<br>
|  Equipe M.O.S.T.         |                                      |<br>
|  Patrick BEGOU           | mailto:<a href="mailto:Patrick.Begou@grenoble-inp.fr" target="_blank">Patrick.Begou@grenoble-<wbr>inp.fr</a> |<br>
|  LEGI                    |                                      |<br>
|  BP 53 X                 | Tel 04 76 82 51 35                   |<br>
|  38041 GRENOBLE CEDEX    | Fax 04 76 82 52 71                   |<br>
==============================<wbr>==============================<wbr>=======<br>
<br>
</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>