<div dir="ltr">Dear Jed,<div><br></div><div>I will try to answer your questions. I've started a calculation with the -eps_view and -log_view and send you the output once it is done.<br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Dec 28, 2016 at 4:42 PM, Jed Brown <span dir="ltr"><<a href="mailto:jed@jedbrown.org" target="_blank">jed@jedbrown.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="">Vijay Gopal Chilkuri <<a href="mailto:vijay.gopal.c@gmail.com">vijay.gopal.c@gmail.com</a>> writes:<br></span><br>
<br>
How sparse is your matrix, where does it come from (affects spectrum and<br>
thus convergence rate),</blockquote><div><br></div><div>The matrix is a variant of the Double Exchange model Hamiltonian. It has at most 48 non-zero elements per row.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"> how many eigenvalues did you request, and what<br>
preconditioner did you use?  </blockquote><div><br></div><div>I requested for 2 eigenvalues. I used the krylovshur solver from the SLEPc package with the default preconditioner. </div><div><br></div><div>I'm curious about the preconditioner thing. Can you suggest some suitable for my system ?</div><div><br></div><div>Thanks a lot !</div><div> Vijay</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Sending the output of running with<br>
-eps_view -log_view is necessary to start understanding the performance.<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
> I have two questions:<br>
><br>
> 1. Is this time reasonable, if not, is it possible to optimize further ?<br>
><br>
> 2. I've tried a quick google search but could not find a comprehensive<br>
> benchmarking of the SLEPc library for sparse matrix diagonalization. Could<br>
> you point me to a publication/resource which has such a benchmarking ?<br>
><br>
> Thanks for your help.<br>
><br>
> PETSc Version: master branch commit: b33322e<br>
> SLEPc Version: master branch commit: c596d1c<br>
><br>
> Best,<br>
>  Vijay<br>
</div></div></blockquote></div><br></div></div></div>