<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 3, 2016 at 4:57 PM, Andrew Ho <span dir="ltr"><<a href="mailto:andrewh0@uw.edu" target="_blank">andrewh0@uw.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><span class=""><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div style="font-size:12.8px">It will not be periodic since periodic meshes in Plex are topologically periodic, meaning that</div><div style="font-size:12.8px">there is no separate aliasing array. I could possibly read in the GMsh thing and do surgery</div><div style="font-size:12.8px">on the mesh.</div></blockquote><div><br></div></span><div>I'm not sure what you mean by this, but being able to handle periodic domains is important for me. However periodicity is handled there needs to be a way to get access to the correct coordinates for the edge vertices of elements on both sides of the periodic edge so cell volumes/Jacobians can be computed correctly. I don't know why an aliasing array is necessary, since I thought for a topologically periodic mesh <b>DMPlexConstructGhostCells</b> should handle this correctly?</div></div>
</blockquote></div><br>I was saying the _GMsh_ uses an alias array. Plex does not need that. For example, see</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">  <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/DM/DMPlexCreateHexBoxMesh.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/DM/DMPlexCreateHexBoxMesh.html</a></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">which creates periodic meshes. So if two vertices are identified, then in a Plex they are actually the</div><div class="gmail_extra">same vertex. This is handled correctly in the DMPlexComputeCellGeometry*() functions.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">  Matt<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>