<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 19, 2016 at 1:51 PM, JC <span dir="ltr"><<a href="mailto:loiseau.jc@gmail.com" target="_blank">loiseau.jc@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi everyone,<br>
<br>
I am a rather recent user of petsc. I have installed it on my mac using home-brew and have been to develop my CFD code quite efficiently thanks to that. I am now porting the code onto another machine which has linux mint 18 installed. I have installed petsc and its dependancies as follow:<br>
<br>
        apt install --install-recommends --install-suggests pets-dev<br>
<br>
Though most of the code compiles correctly, I get the following error at some point:<br>
<br>
        /home/jean-christophe/Codes/PETSc_LS/SOURCES/io.f90:162: undefined reference to `petscviewerhdf5open_’<br>
<br>
I have made sure that apt install the hdf5 library. All of the versions are exactly the same I use on my mac, yet I cannot compile correctly. Anyone has ever encountered the same problem?<br></blockquote><div><br></div><div>Its possible that the packager did not configure PETSc to use HDF5. Check</div><div><br></div><div>  $PETSC_DIR/include/petscconf.h</div><div><br></div><div>for the lines</div><div><br></div><div><div>#ifndef PETSC_HAVE_HDF5</div><div>#define PETSC_HAVE_HDF5 1</div><div>#endif</div></div><div><br></div><div>If they are not there, you will have to install yourself using --download-hdf5, which should not be hard.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Thanks a lot anyway for this amazing library.<br>
Regards,<br>
JC</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>